河北省长爪沙鼠型鼠疫菌基因分型及流行病学研究

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鼠疫是一种自然疫源性疾病,原发于啮齿类动物并能引起人间流行,其传染性强、传播速度快、病死率高,曾引起三次世界性的大流行。河北省鼠疫属于内蒙古高原长爪沙鼠型鼠疫,历史上该型鼠疫曾引起较大规模流行,20世纪70年代至今,河北共发生4次动物间鼠疫,并从疫源地中陆续分离到100多株鼠疫菌株。近年来沙鼠疫源地则持续活跃,而河北省鼠疫自然疫源地又地处沙鼠疫源地边缘;是距离北京最近的鼠疫疫源地,鉴于鼠疫的活跃趋势、严重危害性以及河北省鼠疫自然疫源地特殊地理位置,对该疫源地鼠疫菌的基因遗传特征进行深入研究,具有十分重要的意义。本实验结合鼠疫菌基因组研究的新技术,选用三种分型方法对河北省鼠疫菌进行基因分型,探究河北菌株间的内在联系与遗传特征。差异片段(difference region,DFR)研究结果显示:河北省鼠疫菌株属于Genomovar11型。DFR分型结果与传统的生物分型相一致。规律成簇的间隔短回文重复序列(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats, CRISPR )研究显示:河北省鼠疫菌株分为2个基因型即Cb2和新发现的1基因型。多位点可变数目串联重复序列(Multiple-locus variable-number tandem repeat analysis,MLVA)研究分析:本实验选用26个VNTR位点进行分型,结果显示:河北省鼠疫菌株可分为2个群落5基因型。
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