【摘 要】
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研究目的:通过差异基因表达分析,获得Let-7a-5p与银屑病发病相关。预测Let-7a-5p的靶点,通过体外实验和SNP检测,探索Let-7a-5p对HaCaT细胞增殖的影响以及对银屑病关联SNP进行检测分析。研究方法:（1）对银屑病相关候选miRNAs进行筛选。在NCBI的GEO数据库中下载银屑病相关的表达谱和转录组数据。使用DEseq2进行差异表达基因分析,筛选条件为FDR＜0.1,|log
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研究目的:通过差异基因表达分析,获得Let-7a-5p与银屑病发病相关。预测Let-7a-5p的靶点,通过体外实验和SNP检测,探索Let-7a-5p对HaCaT细胞增殖的影响以及对银屑病关联SNP进行检测分析。研究方法:（1）对银屑病相关候选miRNAs进行筛选。在NCBI的GEO数据库中下载银屑病相关的表达谱和转录组数据。使用DEseq2进行差异表达基因分析,筛选条件为FDR＜0.1,|log2FC|＞1;（2）基于miRDB对候选has-let-7a-5p相应靶点进行预测。利用基因富集分析,得到靶基因,并比较靶基因在银屑病患者和健康对照组中的表达情况;（3）利用体外实验探讨Let-7a-5p对HaCaT细胞增殖的影响;（4）对Let-7结合位点SNP变异进行检测。收集来自东北地区银屑病患者及对照组的血标本,进行DNA提取、PCR扩增及DNA测序。统计各SNPs在两个群体间的基因型分布情况,并进行卡方检验（Graphpad prism 6.0,χ2,P＜0.05意味着统计学差异显著）。研究结果:（1）通过差异基因表达分析筛选发现Let-7a-5p下调最明显,推断可能为Let-7家族中起主要作用的miRNA。我们共获得了133个下调miRNAs和99个上调miRNAs与银屑病相关。在下调的miRNAs中,let-7家族的6个基因（hsa-let-7c-5p,hsa-let-7e-3p,hsa-let-7a-5p,hsa-let-7b-5p,hsa-let-7d-5p和hsa-let-7g-5p）显著性下调,且has-let-7a-5p下调最明显。（2）Let-7a-5p的预测靶点可能为CCL7、MAPK6和MAPK8,但因CCL7基因在银屑病及对照组中的表达量差异较小,将其视为无差异。（3）Let-7a-5p在体外实验中可以显著性抑制HaCaT细胞的增殖。在用TNF-α诱导完HaCaT细胞增殖之后,瞬时转染30nmol/L let-7a-5p模拟物。同时,转染30nmol/L的miRNA分子的随机序列用作阴性对照。结果发现转染let-7a-5p模拟物的实验组中HaCaT细胞增殖受到明显抑制。（4）Let-7a-5p的关联SNP为IL-13基因上的rs848（A/C）,C等位基因会增加银屑病的患病风险。DNA扩增测序后每一个样本的rs848位点基因型统计,发现银屑病患者与健康对照组之间,等位基因频率存在着显著性差异（p＜0.05）,银屑病患者中CC＞AA;同样两组之间的基因型频率也存在着显著性差异（p＜0.05）,即银屑病患者C＞A。研究结论:Let-7家族在银屑病患者中出现显著性下调,其中let-7a的占比最高,下调幅度最大;Let-7a-5p在体外实验中可以显著性的抑制HaCaT细胞的增殖,其作用靶点可能为MAPK6、MAPK8;Let-7a-5p的关联SNP为IL-13基因上的rs848（A/C）,C等位基因会增加银屑病的患病风险。
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