内蒙古自治区高新技术园区在西部大开发中占有重要的地位。对高新区创新能力的合理评价，有助于管理者制定科学全面的发展政策，从而推动高新区的进一步发展。首先，以企业作为创新主体，建立了创新能力评价指标体系。选取9家有代表性的高新区，将各高新区2010年数据，先采用对数函数标准化，并以秩相关系数检验指标之间的相关性。结果表明所选指标满足独立性原则。再采用基于主成分分析法和因子分析法，得到了9家高新区排名。影响高新技术园区创新能力的各个因素是以网络化的方式影响着综合创新力。采用机器学习综合评价法的最大优点就是它的客观性，但它的问题是评价样本不易获得，因此，利用层次分析法(AHP)来设计机器学习法的综合评价样本：将权重看成正态随机变量，将AHP计算值为权重均值，将判断矩阵的一致性比例作为标准差，并利用蒙特卡洛方法，即可随机产生权重，从而得到大量评价样本。再采用随机森林、随机梯度Boosting、支持向量机等6种方法得到综合评价的结果和排序，最后，运用组合预测的思想，对6种方法的综合评价值，进行算术平均，给出9家高新技术园区的排名。因为，新技术产业化需要一定的时间周期，所以，用GDP预测值代替GDP现值，可以更科学地评价创新能力。首先对各高新区GDP的历年数值，进行BDS、Box-Pierce和Ljung-Box等独立性检验，判断出金川工业园区GDP的时间序列是独立但不同分布的，不存在条件异方差性，可以认为服从正态分布，因此选择MA模型。再综合考虑自相关和偏相关函数、信息准则AIC和BIC准则、以及残差是否独立三个方面因素，最终将模型定为MA(4)模型。预测出了2014年GDP，用此值进行评价，得到的各高新区的创新能力比较结果更客观、科学。最后，将”培育高新技术产业群”、”提升自主创新能力”和”完善科技创新服务体系”三个方面作为发展目标，并提出推进高新技术产业发展的七项战略措施，从而推动了内蒙古自治区高新技术产业发展的新跨越。