近年来，随着SARS以及其他公共卫生突发事件的频繁发生，建立公共卫生突发事件应急指挥系统(以下简称公共卫生应急指挥系统)已经成为各国政府应对公共卫生突发事件的主要策略。目前，各国对公共卫生应急指挥系统的研究还处在利用基于预案的文本化查询来应对突发事件的初级阶段。公共卫生应急指挥系统对以往案例及其解决方案的必要参考往往被忽视。 为了解决目前公共卫生应急指挥系统的缺陷，本文提出了结合基于结构化案例的推理(Structural Case—based Reasoning，以下简称SCBR)与基于本体的知识管理(Ontology—based KnowledgeManagement，以下简称OBKM)来构建公共卫生应急指挥系统的解决方案。 SCBR参考特定应用领域的领域模型，定义案例的结构描述，以XML形式结构化存储以往的案例；建立应用领域下相应的案例库。当公共卫生突发事件发生时，SCBR对突发事件以案例结构进行抽象描述；将突发事件与案例库中所有案例进行相似度评估；并检索出与突发事件最相似的若干个案例。通过对若干个最相似的案例的解决方案的学习与修改，SCBR制定出对突发事件的最终解决方案，并对突发事件进行应急指挥。 为了使SCBR具有更灵活、可复用的特点，领域模型与领域知识从SCBR中被分离出去，以形成领域无关的SCBR架构。在领域无关的SCBR架构中，本体技术通过注入不同的领域模型来构建任意应用领域下的应急指挥系统。架构技术的运用实现了应急指挥系统从应用向架构层面的转化，并向构件化复用领域迈进了一步。 虽然领域无关的SCBR架构具有灵活性，可复用性等应用特点，但在没有领域模型注入的前提下，它在特定应用领域下的推理能力仅仅是有限的。在尝试复用领域无关的SCBR架构以形成实际应用时，开发者注入的领域模型的知识点之间往往缺乏必要的联系，甚至出现领域知识孤岛。这种领域知识的管理无法形成有效的领域模型。为了消除传统的领域知识管理的弊病，OBKM被引入本文。领域知识点被本体模型有效地组织起来。OBKM为SCBR提供了健壮的领域模型，并使SCBR的推理能力在特定应用领域下得到了提升。 本文通过结合本体与SCBR两大技术，构建了与领域无关的应急指挥系统架构。在该架构的基础上，本文开发了公共卫生应急指挥系统。通过系统性能分析，本文所开发的公共卫生应急指挥系统能有效为突发事件寻求应急的解决方案。领域无关的应急指挥系统架构的构件化特性使基于SCBR的应急指挥系统的开发更加高效，简单。