三重螺旋模型是近年来新兴的创新模型，强调知识生产单元在创新系统中的主导作用，并强调大学-产业-政府间非线性合作对创新体系的积极影响。政府科研机构是三重螺旋模型下知识生产单元中重要且独特的组成部分，但在众多研究中，政府科研机构并未得到更多重视。因此，本文关注的正是三重螺旋模型下政府科研机构的合作。　　 本文的研究对象是政府科研机构在三重螺旋模型下的合作；目的是构建“合作”的研究框架；重点针对创新中的不同阶段，有针对性地集成不同数据源和分析方法对“政府科研机构的合作”进行研究，并测试研究框架的可行性和有效性。　　 本文从创新过程的角度组织研究思路，将研究分为科学创新、技术创新和创新成效三方面；并根据每个方面的特点，分别采用期刊论文、专利文献和网络链接作为数据源；同时针对不同数据源的特征，本文采用了社会网络分析方法、信息论方法、网络计量法三个主要方法对数据进行分析；最后进行了实验应用。　　 本文的创新之处主要体现在：①对政府科研机构的研究是对三重螺旋中相关研究的补充。②建立“政府科研机构的合作”研究概念框架，并验证其可行性和有效性。③对创新不同阶段中的合作有针对性地采用不同的数据源和分析方法进行研究，④引入社会网络方法，以系统和全面的视角对“政府科研机构的合作”进行研究。⑤用信息理论中的互信息对社会网络中的中心度指标加权，使其对“政府科研机构的合作强度”的诠释更为准确。