兵团特殊体制是与其屯垦戍边的任务目标相适应。在实践中兵团社会事务管理与经济管理并存，并具体化为政治、经济、军事、文化等综合功能。这些功能与新疆的特殊区情相适应，兵团不仅为新疆的经济建设做出了巨大贡献，而且在维护国家安全和社会稳定中发挥着不可替代的作用。　　 改革开放和市场经济发展,使兵团的发展面临着前所未有的困难和挑战，在兵团特殊体制下如何发展市场经济，如何在坚持兵团性质、地位、任务不变的前提下，改革兵团管理体制和转变兵团政府职能，如何培育兵团企业市场主体等是摆在兵团各级领导和广大职工面前的重大现实难题。本文在对新疆兵团特殊体制发展历史和现状分析研究的基础上，比较深入地分析了兵团特殊体制与市场经济发展之间的相互作用以及其不相容性，指出了兵团特殊体制下市场经济发展中存在的问题，分析了制约因素。并且从地理环境因素、农业因素以及营造安定市场经济环境等方面论述了兵团存在的必要性，并得出结论：在市场经济环境下，兵团的特殊地位和作用只能加强，不能削弱。　　 本文在充分论证兵团特殊体制与市场经济发展相互影响基础上，提出了兵团体制改革应遵循兼收并蓄、实事求是、标本兼治等原则，明确了以兵团行政体制改革为突破口，逐步理顺兵团特殊体制党政军企关系，确立其行政职能和经济职能，调整好“政”与“企”关系，强调各管其域、各司其责的改革思路。重新设计了兵团组织体系中职能框架的基本内容，在强化其社会事务管理的同时，对其经济领域进行宏观与微观职能的剥离，由原来具体职能部门统抓、统管的全面管理向重点领域、关键环节转变，强调以适度的行政干预强化宏观经济领域的市场调节、市场监管等职能，构建公平、公正的市场竞争环境；在微观经济领域引入多种市场微观主体，对其坚持市场化的改革方向，以市场机制配置资源提高效率。　　 最后，结合兵团自身实际，着重从突破思想束缚、改善体制改革环境、提高职工素质和加强微观市场主体建设等四个方面，提出切实可行的配套措施，促进市场经济发展环境的营造和建构相应的保障措施，增强兵团特殊体制与市场机制的适应性。特别是在加强微观市场主体方面分别提出了加强企业家队伍建设，建立起符合市场要求的决策主体；加强专业协会等中介组织建设，使其成为市场经济中的“主角”；推动兵团非公有制经济发展，为逐步完善兵团特殊体制的市场经济发展服务。总之，在兵团特殊体制下发展市场经济，应切实凸显市场微观主体的多样性、经营决策的科学性以及经营方式的灵活性，以加快推进兵团的市场化进程。