乙酰胆碱酯酶是一种广泛存在于动物昆虫体内的水解酶，它将神经递质乙酰胆碱水解为胆碱和乙酸，其主要存在于神经肌肉接头与胆碱能神经系统中，在这些地方该酶的作用就是为了终止突触传递。乙酰胆碱酯酶也是老年痴呆等疾病的重要靶标，同时在农业上，乙酰胆碱酯酶抑制剂可以通过抑制昆虫体内的乙酰胆碱酯酶的活性，使昆虫体内的胆碱水平短时间内大量的提高，从而导致其中毒死亡。该类具有代表性的杀虫剂主要有机磷农药和氨基甲酸酯类农药，而这些非可逆性的抑制剂对环境和人类都有很大的危害。近年来也出现了一些非经典的乙酰胆碱酯酶抑制剂，多数为可逆型乙酰胆碱酶抑制剂。这些抑制剂以非共价的方式和乙酰胆碱酯酶结合，大多数也还只是用于治疗老年痴呆。将这些抑制剂改造为农药，可以极大的减小对环境的危害。本文通过研究化合物TZ2PA6对不同种属乙酰胆碱酯酶的相互作用，揭示该化合物在选择性的分子机制，从而为选择性乙酰胆碱酯酶抑制剂的设计作基础性的研究。　　 本文构建了小鼠、电繇和黑腹果蝇乙酰胆碱酯酶与化合物TZ2PA6中的syn1和antil的六个复合物，通过一系列分子模拟的手段，对配体和受体之间的相互作用进行了研究。其中Ⅰ型乙酰胆碱酯酶包括小鼠和电繇，Ⅱ型乙酰胆碱酯包括黑腹果蝇。通过结合自由能计算和能量分解发现，对于催化位点的作用模式都是相似的。由于syn1和antil中间的连接部分不一样，导致连接部分的长度不同，使得在活性腔腔口结合模式不一样。syn1在小鼠和电繇乙酰胆碱酯酶中会形成三明治的π-π相互作用，而antil在两种酶中只有一个π-π相互作用，这就是活性产别的主要原因。同时，外周阴离子部位是选择性产生的主要位置，鼠和电繇乙酰胆碱酯酶的腔口的残基基本相同，小鼠、电繇中的Tyr72和Tyr67，与对应的在黑腹果蝇中的Tyr71取向的不同是导致选择性产生的主要原因。