利用RNA干扰技术研究PARP1在氢醌细胞毒性及DNA甲基化过程中的作用

来源 :中山大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lwm1976
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
研究目的:本研究通过构建PARP1基因的发卡样siRNA(smallinterfereRNA)真核表达载体,利用siRNA载体来抑制PARP1基因的表达,从而探索PARP1蛋白在氢醌细胞毒作用以及DNA甲基化过程中的作用,为进一步研究PARP1的功能奠定基础。 1、材料与方法 1.1材料 1.1.1细胞人支气管上皮细胞(HBE)由广州医学院馈赠,细胞以DMEM/10%FCS,37℃,5%CO2培养,常规培养传代。 1.1.2菌株大肠杆菌DH5α菌株由本教研室保存。 1.1.3质粒载体RNAi-ReadypSIREN-RetroVector购于美国Clontech公司,全长6.4kb,是一带有BamHI和EcoRI两酶切位点的线性载体;pEGFP-C1绿色荧光蛋白载体购于美国Clontech公司,全长4.7kb。 1.2方法 1.2.1发卡样PARP1基因siRNA逆转录病毒载体构建根据GenBank提供的PARP1基因cDNA序列,通过BD公司提供的软件以及BLAST挑选长为19个碱基的特异性寡核苷酸序列(5-ATCTTCTCAAGGCAGACAC-3),合成其发卡样两端配对siRNA寡核苷酸链,同时合成互补链,分别在5和3端引入BamHⅠ和EcoRⅠ酶切位点。将上下链经过变性、复性后形成双链PARP1siRNA。采用DNA重组技术,将PARP1siRNA双链定向克隆入U6启动子指导的逆转录病毒表达载体RNAi-ReadypSIREN-RetroQVector。转化连接子,37℃培养过夜,长出的单个单菌落为转化菌菌落。挑单菌落种于10mlLB(含60μg/ml氨苄青霉素)中,37℃摇菌过夜。收集细菌,按说明书操作小量快速抽提质粒DNA,1%的琼脂糖凝胶电泳检测结果。 1.2.2pEGFP-C1-PARP1siRNA真核表达载体构建选择酶切位点,将包括U6启动子和siRNA序列的片段切下,并亚克隆至入CMV启动子指导的pEGFP-C1荧光蛋白表达载体。转化连接子,37℃培养过夜,长出的单个单菌落为转化菌菌落。挑单菌落种于10mlLB(含50μg/ml卡那霉素)中,37℃摇菌过夜。收集细菌,按说明书操作小量快速抽提质粒DNA,1%的琼脂糖凝胶电泳检测结果。 1.2.3PARP1蛋白缺陷细胞建立HBE细胞常规培养于含10%小牛血清的DMEM培养液,稳定传代后用于本实验。90%融合的HBE细胞,分别转染5μgpEGFP-C1-NegsiRNA、pEGFP-C1-PARPlsiRNA(LIPOFECTIN法),同时设未转染对照。细胞转染48h,换含800μg/lG418、10%小牛血清的DMEM培养液,筛选10-14天,收集细胞,加细胞裂解液PMSF,提取细胞全蛋白。取50μg细胞全蛋白,10%SDS2PAGE电泳,转PVDF膜,1∶500鼠抗人PARP1单抗,Westernblotting检测胞内PARP1的蛋白水平。 1.2.4PARP1蛋白缺陷细胞生物学性状研究通过观察转染细胞生长形态、超微结构、生长特性及细胞周期等生物学特性,了解转染细胞恶性程度情况。 1.2.5PARP1蛋白缺陷细胞对毒物作用的影响以PARP1蛋白缺陷细胞株为模型,用标准断裂剂氢醌(hydroquinone,HQ)染毒,从微核形成率及细胞周期等方面测定细胞遗传毒性,以研究PARP1蛋白功能及其缺陷细胞对HQ细胞毒作用的影响。 1.2.6PARP1蛋白缺陷细胞对DNA甲基化的影响HQ作用PARP1蛋白缺陷细胞后,用甲基化特异性PCR检测其中p16RASSF1A基因启动子区甲基化情况,从RNA及蛋白水平检测p16RASSF1A的表达。2、结果2.1发卡样PARP1基因siRNA设计逆转录病毒载体构建根据GenBank提供的PARP1基因cDNA序列,合成两对发卡样siRNA寡核苷酸链,命名为P1,P2。通过分子克隆和琼脂糖凝胶电泳鉴定,成功构建了发卡样PARP1基因siRNA逆转录病毒载体。同时构建阴性siRNA逆转录病毒载体。 2.2pEGFP-C1-P1siRNA和pEGFP-C1-P2siRNA真核表达载体的构建经过亚克隆和琼脂糖凝胶电泳鉴定,成功获得pEGFP-C1-P1siRNA和pEGFP-C1-P2-siRNA真核表达载体。同时构建阴性siRNA荧光蛋白真核表达载体pEGFP-C1-NsiRNA。 2.3PARP1蛋白缺陷细胞建立对于三种质粒用脂质体法转染HBE细胞48h后,在荧光显微镜下观察到细胞绿色荧光蛋白表达,正式转染成功,分别命名为HBEP1,HBEP2和HBEN,G418筛选后,提取细胞全蛋白,Westernblotting鉴定,结果发现三者的PARP1蛋白表达分别为92.4%,17.8%和95.2%。说明pEGFP-C1-P2-siRNA载体能够明显抑制HBE细胞的PARP1表达。所以在后续实验中使用该载体进行研究,将相应转染的细胞命名HBEP细胞。 2.4PARP1蛋白缺陷细胞生物学性状研究 2.4.1细胞生长形态观察转染初期HBEN、HBEP细胞形态变化明显,失去类圆形生长,细胞内颗粒明显增多,细胞形态成不规则型,但随着传代培养时间的增加,3种细胞形态趋于一致。 2.4.2细胞超微结构变化HBE细胞核膜清晰完整,核仁明显,线粒体膜完整,嵴明显;HBEN、HBEP细胞形状不规则,细胞核缩小、变形,胞浆出现空泡,基质不明显,嵴消失。 2.4.3细胞生长曲线3种细胞生长曲线均呈“S”形;三者生长速度接近。表明PARP1蛋白缺陷对细胞增殖能力无明显影响。 2.4.4细胞周期观察三种细胞在G1、G2和S期的分布无显著性差异(P>0.05),提示载体对细胞周期影响不大。 2.5PARP1蛋白缺陷细胞对毒物作用的影响 2.5.1细胞存活率用MTT法测定细胞生长抑制率分析,HQ对HBE和HBEP细胞的生长抑制作用在0~80μmol/L范围内与剂量正相关。 2.5.2HBE和HBEP细胞微核结果HBE、HBEN和HBEP细胞经、HQ染毒后,各剂量组不同程度出现含微核的细胞,含微核的细胞中有一个或数个微核,与各自对照组比较,从20μmol/L的HQ剂量组开始HBE和HBEP细胞的微核率明显增加(P<0.05)。相关分析结果表明,两种细胞的微核率与HQ剂量间存在量效关系。 2.5.3HBE和HBEP细胞染毒后细胞周期结果随氢醌剂量增加,两组细胞均出现G2期阻滞,以HBEP更为明显。同时,对于HBEP还表现S期阻滞,但HBE细胞没有S期阻滞。 2.5.4HBE和HBEP细胞的彗星实验结果各剂量HQ处理后,两种细胞的彗星实验存在差别。其中HBE细胞表现出DNA损害率与HQ剂量正相关。HBEP细胞在20-100μMHQ处理后,DNA损害率大于HBE,但当HQ剂量增加到160μM时,HBE的DNA损害程度比HBEP细胞严重。 2.6PARP1缺陷与DNA甲基化关系 2.6.1DNMT1的mRNA及蛋白表达:在HQ处理后的HBEP细胞中,DNMT1的表达增加,其RNA水平在染毒后第三天开始见到明显上升(2.5),第5天达到高峰(5.8)。相应DNMT1的蛋白表达水平也增加。而在HQ处理HBE细胞则DNMT1表达无明显变化。 2.6.2p16和RASSF1A基因启动子区域甲基化状态检测经过HQ处理和未经HQ处理的HBEP细胞,其p16和RASSF1A基因启动子区域的MSP检测,都出现具有甲基化与未甲基化两种条带,而HBE细胞无论HQ处理与否,均只有未甲基化条带。 2.6.3p16和RASSF1A的mRNA表达检测对HBEP细胞进行p16和RASSF1ART-PCR检测,发现相应mRNA表达降低,而在在5-Aza-CdR处理后,则上调。 3、结论:成功利用RNA干扰技术抑制PARP1基因表达,为研究PARP1基因的功能打下基础。 在正常生长环境下,PARP1蛋白缺陷对细胞生长形态、超微结构、生长速度以及细胞周期有轻微的影响。 PARP1参与了细胞HQ所致毒性的应答。且具有双相性,既在中低剂量HQ作用下,PARP1的作用促进细胞修复,在高剂量HQ作用下,由于PARP1过度激活,促进细胞死亡。 PARP1参与了DNA甲基化调节,PARP1催化形成的分支状长链结构能够阻止DNA甲基转移酶的作用。
其他文献
从上世纪90年代初开始,电视文化迅速成为一种流行的概念。这一概念的出现,有其特定的历史文化背景。许多研究者纷纷从各自的角度对电视文化做了大量的研究。但就目前的研究状
本文推导出在非均布荷载作用下复合井壁的内力表达式,认为应考虑圆形井壁的曲率,给出井壁应力计算公式.并且通过一算例,把导出的井壁应力公式计算结果与国内、外广泛采用的H
钻头钎焊工艺之所以重要,在于迄今为止钎焊是在中、小型钻头上固定硬质合金的主要工艺。虽然七十年代出现了过盈冷压柱齿钻头,打破了钎焊钻头的一统天下,但其数量较少,在当
一、历史和现状容器式管道输送系统就是把要输送的物料装入容器,然后把容器送入管道中,由管道中具有一定压力的流体进行输送的一种系统。容器式管道输送并不是什么新的概念,
在选矿厂中,磨矿-分级是关键性的作业之一,其任务是为后续选别作业提供既充分单体解离而又不过粉碎的给料。国内外选矿界业已公认,如果不采取某种形式的自动控制,则磨矿-分
目的:  通过测定不同饮水砷浓度人群血液AhRmRNA和CYP1A1mRNA的表达水平,分析二者异常表达与砷引起的健康效应之间存在的潜在关系,并进一步探讨砷的致病机理。  方法:  本
金口岭矿铜钼系统于73年投产。设计前做过可选性试验,由于试料未采入碳岩,试验指标均较高。投产初期钼精矿品位达到35%,回收率53%,74年钼精矿品位下降到20%,回收率46~63%。为查明
本文提出边帮剥采比的概念,并推导出应用边帮剥采比等于经济合理剥采比圈定境界的基本公式,阐述了用边帮剥采比圈定露天开采境界的方法,其中以图解法尤为迅速准确。 This pa
本文主要对动物芥子气全身吸收中毒防治药物及救治措施进行了研究。首先通过实验确定了4mg/kg体重中毒剂量作为用于芥子气防治药物筛选实验的SD大鼠中毒剂量并建立相应模型。
本文在可交换的条件下,当响应变量为多维时,研究利用多维结构回归模型求总体平均处理效应的估计方法,讨论混杂偏倚的控制问题,分析混杂因子和测量误差对总体平均处理效应估计的影