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研究目的:本研究通过构建PARP1基因的发卡样siRNA(smallinterfereRNA)真核表达载体,利用siRNA载体来抑制PARP1基因的表达,从而探索PARP1蛋白在氢醌细胞毒作用以及DNA甲基化过程中的作用,为进一步研究PARP1的功能奠定基础。
1、材料与方法
1.1材料
1.1.1细胞人支气管上皮细胞(HBE)由广州医学院馈赠,细胞以DMEM/10%FCS,37℃,5%CO2培养,常规培养传代。
1.1.2菌株大肠杆菌DH5α菌株由本教研室保存。
1.1.3质粒载体RNAi-ReadypSIREN-RetroVector购于美国Clontech公司,全长6.4kb,是一带有BamHI和EcoRI两酶切位点的线性载体;pEGFP-C1绿色荧光蛋白载体购于美国Clontech公司,全长4.7kb。
1.2方法
1.2.1发卡样PARP1基因siRNA逆转录病毒载体构建根据GenBank提供的PARP1基因cDNA序列,通过BD公司提供的软件以及BLAST挑选长为19个碱基的特异性寡核苷酸序列(5-ATCTTCTCAAGGCAGACAC-3),合成其发卡样两端配对siRNA寡核苷酸链,同时合成互补链,分别在5和3端引入BamHⅠ和EcoRⅠ酶切位点。将上下链经过变性、复性后形成双链PARP1siRNA。采用DNA重组技术,将PARP1siRNA双链定向克隆入U6启动子指导的逆转录病毒表达载体RNAi-ReadypSIREN-RetroQVector。转化连接子,37℃培养过夜,长出的单个单菌落为转化菌菌落。挑单菌落种于10mlLB(含60μg/ml氨苄青霉素)中,37℃摇菌过夜。收集细菌,按说明书操作小量快速抽提质粒DNA,1%的琼脂糖凝胶电泳检测结果。
1.2.2pEGFP-C1-PARP1siRNA真核表达载体构建选择酶切位点,将包括U6启动子和siRNA序列的片段切下,并亚克隆至入CMV启动子指导的pEGFP-C1荧光蛋白表达载体。转化连接子,37℃培养过夜,长出的单个单菌落为转化菌菌落。挑单菌落种于10mlLB(含50μg/ml卡那霉素)中,37℃摇菌过夜。收集细菌,按说明书操作小量快速抽提质粒DNA,1%的琼脂糖凝胶电泳检测结果。
1.2.3PARP1蛋白缺陷细胞建立HBE细胞常规培养于含10%小牛血清的DMEM培养液,稳定传代后用于本实验。90%融合的HBE细胞,分别转染5μgpEGFP-C1-NegsiRNA、pEGFP-C1-PARPlsiRNA(LIPOFECTIN法),同时设未转染对照。细胞转染48h,换含800μg/lG418、10%小牛血清的DMEM培养液,筛选10-14天,收集细胞,加细胞裂解液PMSF,提取细胞全蛋白。取50μg细胞全蛋白,10%SDS2PAGE电泳,转PVDF膜,1∶500鼠抗人PARP1单抗,Westernblotting检测胞内PARP1的蛋白水平。
1.2.4PARP1蛋白缺陷细胞生物学性状研究通过观察转染细胞生长形态、超微结构、生长特性及细胞周期等生物学特性,了解转染细胞恶性程度情况。
1.2.5PARP1蛋白缺陷细胞对毒物作用的影响以PARP1蛋白缺陷细胞株为模型,用标准断裂剂氢醌(hydroquinone,HQ)染毒,从微核形成率及细胞周期等方面测定细胞遗传毒性,以研究PARP1蛋白功能及其缺陷细胞对HQ细胞毒作用的影响。
1.2.6PARP1蛋白缺陷细胞对DNA甲基化的影响HQ作用PARP1蛋白缺陷细胞后,用甲基化特异性PCR检测其中p16RASSF1A基因启动子区甲基化情况,从RNA及蛋白水平检测p16RASSF1A的表达。2、结果2.1发卡样PARP1基因siRNA设计逆转录病毒载体构建根据GenBank提供的PARP1基因cDNA序列,合成两对发卡样siRNA寡核苷酸链,命名为P1,P2。通过分子克隆和琼脂糖凝胶电泳鉴定,成功构建了发卡样PARP1基因siRNA逆转录病毒载体。同时构建阴性siRNA逆转录病毒载体。
2.2pEGFP-C1-P1siRNA和pEGFP-C1-P2siRNA真核表达载体的构建经过亚克隆和琼脂糖凝胶电泳鉴定,成功获得pEGFP-C1-P1siRNA和pEGFP-C1-P2-siRNA真核表达载体。同时构建阴性siRNA荧光蛋白真核表达载体pEGFP-C1-NsiRNA。
2.3PARP1蛋白缺陷细胞建立对于三种质粒用脂质体法转染HBE细胞48h后,在荧光显微镜下观察到细胞绿色荧光蛋白表达,正式转染成功,分别命名为HBEP1,HBEP2和HBEN,G418筛选后,提取细胞全蛋白,Westernblotting鉴定,结果发现三者的PARP1蛋白表达分别为92.4%,17.8%和95.2%。说明pEGFP-C1-P2-siRNA载体能够明显抑制HBE细胞的PARP1表达。所以在后续实验中使用该载体进行研究,将相应转染的细胞命名HBEP细胞。
2.4PARP1蛋白缺陷细胞生物学性状研究
2.4.1细胞生长形态观察转染初期HBEN、HBEP细胞形态变化明显,失去类圆形生长,细胞内颗粒明显增多,细胞形态成不规则型,但随着传代培养时间的增加,3种细胞形态趋于一致。
2.4.2细胞超微结构变化HBE细胞核膜清晰完整,核仁明显,线粒体膜完整,嵴明显;HBEN、HBEP细胞形状不规则,细胞核缩小、变形,胞浆出现空泡,基质不明显,嵴消失。
2.4.3细胞生长曲线3种细胞生长曲线均呈“S”形;三者生长速度接近。表明PARP1蛋白缺陷对细胞增殖能力无明显影响。
2.4.4细胞周期观察三种细胞在G1、G2和S期的分布无显著性差异(P>0.05),提示载体对细胞周期影响不大。
2.5PARP1蛋白缺陷细胞对毒物作用的影响
2.5.1细胞存活率用MTT法测定细胞生长抑制率分析,HQ对HBE和HBEP细胞的生长抑制作用在0~80μmol/L范围内与剂量正相关。
2.5.2HBE和HBEP细胞微核结果HBE、HBEN和HBEP细胞经、HQ染毒后,各剂量组不同程度出现含微核的细胞,含微核的细胞中有一个或数个微核,与各自对照组比较,从20μmol/L的HQ剂量组开始HBE和HBEP细胞的微核率明显增加(P<0.05)。相关分析结果表明,两种细胞的微核率与HQ剂量间存在量效关系。
2.5.3HBE和HBEP细胞染毒后细胞周期结果随氢醌剂量增加,两组细胞均出现G2期阻滞,以HBEP更为明显。同时,对于HBEP还表现S期阻滞,但HBE细胞没有S期阻滞。
2.5.4HBE和HBEP细胞的彗星实验结果各剂量HQ处理后,两种细胞的彗星实验存在差别。其中HBE细胞表现出DNA损害率与HQ剂量正相关。HBEP细胞在20-100μMHQ处理后,DNA损害率大于HBE,但当HQ剂量增加到160μM时,HBE的DNA损害程度比HBEP细胞严重。
2.6PARP1缺陷与DNA甲基化关系
2.6.1DNMT1的mRNA及蛋白表达:在HQ处理后的HBEP细胞中,DNMT1的表达增加,其RNA水平在染毒后第三天开始见到明显上升(2.5),第5天达到高峰(5.8)。相应DNMT1的蛋白表达水平也增加。而在HQ处理HBE细胞则DNMT1表达无明显变化。
2.6.2p16和RASSF1A基因启动子区域甲基化状态检测经过HQ处理和未经HQ处理的HBEP细胞,其p16和RASSF1A基因启动子区域的MSP检测,都出现具有甲基化与未甲基化两种条带,而HBE细胞无论HQ处理与否,均只有未甲基化条带。
2.6.3p16和RASSF1A的mRNA表达检测对HBEP细胞进行p16和RASSF1ART-PCR检测,发现相应mRNA表达降低,而在在5-Aza-CdR处理后,则上调。
3、结论:成功利用RNA干扰技术抑制PARP1基因表达,为研究PARP1基因的功能打下基础。
在正常生长环境下,PARP1蛋白缺陷对细胞生长形态、超微结构、生长速度以及细胞周期有轻微的影响。
PARP1参与了细胞HQ所致毒性的应答。且具有双相性,既在中低剂量HQ作用下,PARP1的作用促进细胞修复,在高剂量HQ作用下,由于PARP1过度激活,促进细胞死亡。
PARP1参与了DNA甲基化调节,PARP1催化形成的分支状长链结构能够阻止DNA甲基转移酶的作用。