目的探讨感染中国寻常疣和跖疣患者的主要人乳头瘤病毒(human papillomavirus，HPV)型别及主要HPV型别与临床特征关系的差异。方法记录473例寻常疣和356例跖疣患者的性别、年龄、病程、症状、疣体个数和大小等临床信息；使用咽拭子擦拭靶疣表面10次或用外科手术刀片刮除靶疣的部分疣体组织获取疣体标本。用DNA提取试剂盒提取标本组织的DNA后，使用聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction，PCR)、基因测序和TA克隆(TA cloning)技术检测标本的HPV型别；分别采用构成比和组间、组内卡方检验比较感染寻常疣和跖疣患者的HPV型别及其与临床特征关系的差异。结果比较寻常疣和跖疣患者的临床特征发现，老年(≥60岁)、单发疣体和有瘙痒症状的寻常疣患者百分比显著高于跖疣患者(P＜0.05)；而多发疣体、有疼痛症状的跖疣患者百分比显著高于寻常疣患者(P＜0.05)。寻常疣和跖疣患者HPV阳性检出率分别为93.4%和99.2%，其中寻常疣患者单一HPV型别检出率明显低于跖疣患者(80.8%和94.3%)。在寻常疣和跖疣患者中，均检测出3个HPV属5个HPV种，共7个HPV型别，Mu属的HPV1和Alpha属的HPV2/27/57是感染寻常疣和跖疣患者的共同主要型别，而Alpha属的HPV7是感染寻常疣患者的主要型别；HPV1型别跖疣患者比例明显高于HPV1型别寻常疣患者(41.1%和19.7%)。寻常疣和跖疣患者混合感染型别组合均由两者的主要单一型别构成，其中HPV1和27组合占比均最高，分别占寻常疣和跖疣患者混合感染的38.8%和70.0%。HPV型别与临床特征关系比较发现，与HPV2/7/27/57型别相比，HPV1型别跖疣患者除和HPV1型别寻常疣患者一样，具有疣体单发、疼痛比例高的临床特征外，还具有更易感染青少年(≤17岁)、病程短(≤12月)及疣体中等大小(0.5cm-1cm)的临床特征。与HPV2/27/57型别寻常疣相比，HPV7型别寻常疣好发于男性患者；HPV27型别寻常疣老年患者显著多于HPV2/57型别寻常疣老年患者。结论寻常疣和跖疣患者的临床特征、主要HPV型别及主要HPV型别与临床特征的关系均存在差异。