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本论文的主要内容是用微卫星技术进行中国对虾（Fenneropenaeus chinensis）的家系识别研究以及用RAPD与SSR两种分子生物学技术构建中国对虾的遗传连锁图谱。一方面对微卫星DNA技术在中国对虾亲缘关系鉴定中应用的可行性进行验证，寻找家系特异性标记，为中国对虾家系混养及特异性标记相关的选育和基因定位提供技术支撑。另一方面，构建中等密度的中国对虾遗传连锁图谱为中国对虾分子标记辅助育种（MAS）、比较基因组作图及数量性状位点（QTL）的定位与克隆奠定基础。 用6个微卫星标记对中国对虾的5个控制交尾家系进行了系谱鉴别和遗传多样性研究。6个微卫星位点中除了EN0018位点以外都是多态的，并在所有家系中都显示了高度的遗传差异。5个多态位点的多态信息含量（PIC）分别是：EN0033位点0.8065，RS0683位点0.6968，RS0859位点0.7287，RS062和RS0622位点0.7414。5个家系中，5个多态微卫星位点共发现了30个等位基因，每个位点的等位基因数在5～8之间。实验中共发现了4个家系特异性等位基因：2#家系及4群家系各1个，5#家系2个。5个位点共获得60个基因型，根据已知亲本及子代基因型，可推断出5个家系中全部亲本的基因型，据此鉴别各家系。在EN0033位点，可将5#家系与其它4个家系相区别，在RS0859位点，可将3#和4#家系与其它3个家系相区分。因此，EN0033和RS0859标记可用于鉴别5#、3#和4#家系的家系特异性标记。研究表明用5个微卫星标记，且最少用2对微卫星标记RS062或RS0622与RS0859组合即可鉴别5个家系。本研究中5个微卫星标记的个体识别率（DP），在0.8556到0.9144之间，累积个体识别率(CDP)则达到0.99998，属于高识别力的遗传标记系统，充分证明可以利用它们进行中国对虾的亲权关系鉴定。 利用RAPD和SSR分子标记结合拟测交策略，对中国对虾“黄海1号”雌虾与野生雄虾作为亲本进行单对杂交产生的F1代，采用RAPD和SSR两种分子