中慢生型天山根瘤菌能够在甘草的根部共生结瘤固氮，提供植物生长所需的氮源。这种共生关系的建立依赖于根瘤菌与宿主植物之间复杂的信息交流。在甘草萌发初期，其分泌的抗菌物质刀豆氨酸能够杀死植株周围可能的有害细菌，而在天山根瘤菌中存在着刀豆氨酸的外运系统MsiAR系统，使其在甘草根际选择性的环境下继续繁殖，成为优势菌群，为后来的结瘤共生提供有力条件。　　MsiR蛋白，属于LysR转录调控家族成员，能够启动msiA基因的表达，刀豆氨酸作为辅助诱导物。LysR型转录调控蛋白是原核生物转录调控蛋白中最大的一类家族蛋白，参与调控的基因类型多种多样，包括毒力、代谢、群体感应和游动性等多种功能基因。本文以MsiR为主要研究对象，探究MsiR对msiA基因表达的调控机制，丰富对LysR家族的转录调控机制的认识，实现工业应用的价值。　　为研究MsiR对msiA的调控机制，将MsiR在大肠杆菌中进行重组表达及纯化。通过EMSA实验证实MsiR蛋白与启动子DNA的结合，加入刀豆氨酸能增强这种结合。与此同时，通过等温量热滴定确定了刀豆氨酸与MsiR之间存在相互作用，刀豆氨酸与MsiR结合的化学计量数为1，Kd值为1.86μM。　　通过5race实验确定了msiA基因的转录起始位点，并由此推测了-10区和-35区。采用启动子长度步移及定点突变确定了影响MsiR转录调控活性的5个重要位点:RBS-1(-70,-67)、RBS-2(-59,-56)、 ABS-1(-50,-47)、 ABS-2(-41,-37)、ABS-3(-30，-27)，并由此预测了MsiR蛋白的转录调控模型:　　无刀豆氨酸存在的情况下，MsiR以四聚体形式存在，并呈现出开放型的构象，其结合到msiA调控区的RBS-1、RBS-2、ABS-2、ABS-3位点。此时，DNA的弯曲角度较缓，MsiR遮住了msiA启动子的-35区，使RNA聚合酶与启动子DNA结合效率大大降低，基因的表达水平处于极低的状态。　　在加入了刀豆氨酸以后MsiR仍以四聚体形式存在，但转变成为紧缩型的构象结合到msiA调控区的RBS-1、RBS-2、ABS-2位点，此时，DNA的弯曲角度变大，被遮盖的msiA启动子的-35区暴露出来，RNA聚合酶与启动子DNA的结合效率有了明显的提高，基因的表达水平处于较高的状态。　　最后，本研究构建了MsiR突变文库，进行了丧失转录调节活性突变株和37℃诱导高可溶性突变株的筛选，得到了影响MsiR生理特性的重要位点，具有十分重要的理论价值。