高校内部资源主要包括人力资源、财力资源、物力资源等。当前我国高校内部资源配置机制中存在着不合理现象，运行效率和效益也不高。人力资源配置方面存在着人员配置结构不合理、激励方式不科学、人员利用效率不高等问题；财力资源配置方面存在着资金投入不足和筹资渠道单一、校内分配不合理、资金利用效率低下等问题；物力资源配置方面存在着物力资源投入不足、规模效益低下、木桶现象的存在等问题。这些问题的存在使高校内部资源配置机制的改革成为高校发展的必要和必需行动。针对其中存在的具体问题，我们应对高校内部的人力、财力、和物力资源进行合理科学的配置；对教职工采取灵活有力的激励方式，增强教师参与治校的权力；拓宽高校的筹资渠道，建立现代高校财务管理制度；适当加大对高校物力资源的投入，实现校内物力资源的规模效益；从总体上提高人力、财力、物力资源的利用效率和效益，促进高校健康有力的发展，充分发挥高校培养高质量人才和创新知识的作用。