基于Ion torrent测序技术的非小细胞肺癌EGFR突变情况的研究

来源 :大连医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xiaopanzi250
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目的:应用Ion torrent基因测序技术检测非小细胞肺癌的EGFR基因突变,并统计分析EGFR基因突变率及突变类型,以探索Ion torrent基因测序技术的临床适用性。方法:收集74例非小细胞肺癌患者的石蜡包埋组织标本和47例正常肺组织的石蜡包埋组织标本,应用Ion torrent基因测序技术检测NSCLC的EGFR基因突变情况,并对EGFR基因外显子18~21各突变类型进行统计分析。结果:74例非小细胞肺癌患者标本,在性别比例上,男43例,占58.1%,女31例,占41.9%;在年龄构成上,在28~80岁之间,平均年龄在60.51±11.23岁,其中,年龄≥61岁组38例,占51.4%,年龄<61岁组36例,占48.6%;在病理类型上,鳞癌19例,占25.7%,腺癌51例,占68.9%,其他类型非小细胞肺癌4例,占5.4%;在吸烟情况上,吸烟者24例,占32.4%,非吸烟患者50例,占67.7%;在肺癌分期上,Ⅰ期(ⅠA+ⅠB)17例,占23.0%,Ⅱ期(ⅡA+ⅡB)13例,占17.6%,Ⅲ期(ⅢA+ⅢB)34例,占45.9%,Ⅳ期10例,占13.5%。经Ion torrent基因测序技术检测EGFR基因外显子18~21的基因突变,外显子18突变主要在发生DNA链上的碱基序列第719位密码子上的错义突变;外显子19突变主要发生在DNA链上的碱基序列第746~753位密码子上,均为碱基删除突变,其中,最常见的突变类型是delE746-A750;外显子20突变主要发生在DNA链上的碱基序列第768、768、774位密码子上,均为碱基的错义突变;外显子21突变位置在DNA链上的碱基序列第848、858、861位密码子上的碱基错义突变,但是,L858R是替代突变的最常见发生部位。EGFR基因外显子18~21总的突变率约为41.9%(31/74);外显子19突变占12例,约占38.7%;外显子21突变16例,约占51.6%,外显子19和外显子21突变共占90.3%左右。外显子20突变3例,约占9.7%,外显子18突变2例,约占6.5%。EGFR基因突变率在性别比例、吸烟情况以及病理类型之间的比较,差异均有统计学意义,即P<0.5;在肺癌分期、年龄组之间的比较,差异均无统计学意义,即P>0.5。而正常肺组织标本中检测出的EGFR基因均为野生型。结论:EGFR基因突变约占非小细胞肺癌总数的41.9%,其中外显子19、21突变占突变总数90.3%。
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