豫南黑猪与引进猪种FSHβ和PRLR基因多态性及其与繁殖性能的关联性分析

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豫南黑猪是以地方猪种—淮南猪为母本,美系杜洛克猪为父本,经过杂交、横交固定而新培育出的一个瘦肉型品种。目前为止,尚未对豫南黑猪FSHβ和PRLR基因进行研究。本试验主要以豫南黑猪为试验材料以杜洛克猪、长白猪及大约克猪3个引进猪种为对照,对这两个基因的多态性及其与繁殖性能的关系进行研究,以探讨这两个基因作为分子标记在豫南黑猪育种工作中的应用。1.FSHβ基因遗传变异分析FSHβ基因内含子1含有缺失片段,设计引物扩增该区域,对缺失片段测序发现,缺失片段大小为277bp,且片段内含有一个SNP多态位点(A→G突变)。采用PCR-RFLP技术检测4个猪种FSHβ基因多态性得到,3个等位基因、6种基因型。豫南黑猪等位基因A、B、C频率分别为0.0738、0.6475、0.2787;基因型AA、AB、AC、BB、BC、CC频率分别为0.0164、0.0246、0.0902、0.4426、0.3852、0.0410;多态信息含量0.3451,杂合度0.4434,不同基因型在群体内分布豫南黑猪与引进猪种之间有极显著差异(P<0.01)。基因型与产仔性能关联性分析得到,CC型豫南黑猪初产总产仔数和产活仔数比AC型分别多2.67和2.79头(P<0.05),经产分别多2.03和2.14头(P<0.05);而引进猪种初产和经产都没有显著差异。2.PRLR基因遗传变异分析分别在PRLR基因内含子9和外显子10上设计引物位点P1、P2。对P1位点克隆测序发现,在此区域内有5个位点突变(G756A、T892G、C924A、C1055G、T1078G)。采用PCR-SSCP技术对P1位点研究,发现3个等位基因、5种基因型,未发现AB基因型。豫南黑猪等位基因A、B、C频率分别为0.19、0.59、0.22;基因型AA、AC、BB、BC、CC频率分别为0.16、0.06、0.50、0.19、0.09;多态信息含量0.5051,杂合度0.5675。基因型在4个群体中分布未达到哈代温伯格平衡状态。不同基因型在群体内分布豫南黑猪与引进猪种之间没有显著差异。基因型与产仔性能关联性分析得到,豫南黑猪不同基因型对产仔数没有显著影响;引进猪种CC基因型初产产活仔数比BC型多产2.38头,差异显著(P<0.05)。采用PCR-RFLP技术检测4个猪种P2位点多态性得到,2个等位基因、3种基因型,豫南黑猪等位基因A、B频率分别为0.5811、0.4189;基因型AA、AB、BB频率分别为0.3343、0.5135、0.1622;多态信息含量0.3683,杂合度0.4868。不同基因型在群体内分布豫南黑猪与引进猪种之间没有显著差异。基因型与产仔性能关联性分析得到,豫南黑猪不同基因型对产仔数没有显著影响,但都呈现BB>AB>AA的趋势;引进猪种BB型经产总产仔数和产活仔数比AB型分别多2.04头和2.53头,差异显著(P<0.05)。AB型母猪断奶重比AA、BB型重0.37kg,差异显著(P<0.05)。3.通过在内含子8和内含子9上设计引物,扩增出149bp的片段,序列分析得到75bp的外显子9。测序显示在内含子8的第559位点可能一个新的SNP位点(C/T),有待进一步验证。结论:1豫南黑猪与引进猪种FSHβ基因不同基因型在群体内分布差异极显著。豫南黑猪群体内多态信息含量较高,群体内遗传变异程度较大。基因型CC型在产仔数上是优势基因型,而其他猪种不存在这种相关性。2 PRLR基因P1、P2位点,豫南黑猪与引进猪种不同基因型在群体内分布没有显著差异。豫南黑猪群体内两位点多态信息含量较高,群体内遗传变异程度较大,而不同基因型对产仔数没有显著影响。P1位点各群体基因型分布未达到哈代温伯格平衡状态, CC基因型引进猪种在初产产活仔数上为优势基因型;P2位点BB基因型引进猪种在经产产仔数上为优势基因型。3扩增出猪PRLR基因exon9,在intron8上可能会有一个新SNP。
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