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三七(Panax notoginseng)根腐病一直以来阻碍着三七种植业发展,也是三七连作障碍产生的重要因素之一;以黄腐型和急性青枯型根腐病影响最为严重。进一步分离研究三七根腐病病原真菌,有利于揭示三七根腐病病原真菌的致病现象及更新生物防治方法。因此,三七根腐病病原真菌的研究仍是一项非常有意义和价值的工作。通过高通量测序对急性青枯型、黄腐型三七根腐病根部真菌种群组成进行研究,结果表明,急性青枯型、黄腐型三七根部真菌种群组成与健康三七相比具有明显差异。健康三七根部真菌分属于以unclassified Mortierellales、Mortierella为主的125个属,急性青枯型三七根部真菌分布于16个真菌属,其中Fusarium、 Cylindrocarpo、Ilyonectria和Monographella分别占整个种群数量的73.37%、9.57%、6.41%、5.14%,黄腐型三七根部真菌分布于16个真菌属,主要由unclassfied和Ilyonectria组成,所占种群数量的比例分别为75.47%和24.02%。通过对急性青枯型三七根部真菌进行分离,得到34株真菌菌株。对黄腐型三七根部真菌进行分离,得到16株真菌菌株。选取不同形态的菌株进行ITS (internal transcribed spacer)基因扩增、测序以及序列分析,结果显示,急性青枯型三七根部分离获得的真菌分属于11个目、16个科、17个属,它们分别是Penicillium、 Mycocentrospora、Cladosporium、Fusarium、Trichoderma、Colletotrichum、Diaporthe、 Phoma、Alternaria、Mortierella、Mucor、Epicoccum、Chaetomium、Cylindrocarpon、 Periconia、Botrytis、Plectosphaerellao黄腐型三七根部分离获得的真菌隶属于7个目、11个科、11个属,分别是Trichoderma、Fusarium、Clonostachys、Epicoccum、 Alternaria、Phoma、Cladosporium、Galactomyces、Mortierella、Mucor、 Plectosphaerella。分离得到的50株真菌中,除菌株PH30321(Fusarium axysporum)、 PH30372(Cylindrocarpon olidum)、PH30365(Alternaria tenuissima)、PH30340(Phoma herbarum)、PH30308(Fusarium oxysporum)已作为三七根腐病病原真菌报道外,对剩余的具有不同形态特征的43株真菌进行回接实验,结果表明,菌株PH30355、PH30353、PH30306也具有三七根腐病的致病性。通过真菌形态特征及ITS基因序列分析,将菌株PH30353、PH30355、PH30306分别鉴定为Plectosphaerella cucumerina、Fusarium flocciferum、Epicoccum nigrum。