三疣梭子蟹（Portunus trituberculatus）是具有先天性免疫机制的无脊椎动物，并且是重要的海水养殖品种，但病害的日趋严重影响了产业的发展。为此展开免疫机制的深入研究，有助于其免疫力的提高，为其健康养殖提供科学的理论依据。　　Toll样受体是在先天性免疫过程中发挥重要作用的模式识别受体。本研究采用RACE方法从三疣梭子蟹中克隆到1个新的Toll样受体基因PtToll4，研究结果显示：PtToll4的cDNA全长3084bp，ORF为2685bp，编码894个氨基酸；此外，蛋白结构域预测结果表明：PtToll4具有Toll样受体的典型结构：一个起始的信号肽，胞外LRR结构域，一个跨膜区和一个胞内TIR结构域；系统进化树结果表明：PtToll4与中华绒螯蟹EsToll2的相似性最高，达到62.2%，与凡纳滨对虾LvToll1、斑节对虾PmToll、中国名对虾FcToll相似性都比较高，与果蝇DmToll1的相似性较虾蟹类的低，达到21.7%。　　利用半定量和实时荧光定量（qPCR）方法进行分析，组织分析结果显示：PtToll4在血淋巴和鳃中的表达量较高，其他组织中表达量较低，可见PtToll4具有明显的组织分布差异性；表达量最高的血淋巴的3种类型细胞中的分析结果显示：PtToll4主要在大颗粒细胞中表达，在透明细胞和小颗粒细胞中表达量很低；血淋巴组织中PtToll4在金黄色葡萄球菌、溶藻弧菌、假丝酵母菌、磷壁酸、脂多糖、肽聚糖的免疫刺激下表达分析结果显示：溶藻弧菌和脂多糖均能引起PtToll4表达量显著上调，金黄色葡萄球菌和假丝酵母菌使其显著下调，表明PtToll4可能参与三疣梭子蟹的先天性免疫机制调节。　　通过构建重组载体，将pAc5.1-EGFP和pAc5.1-EGFP-Toll4转染果蝇S2细胞，观察定位拍照，结果显示：细胞中成功正确表达PtToll4蛋白，主要在细胞膜上有绿色荧光，表明PtToll4是一种定位在细胞膜上工作的跨膜蛋白。　　抗菌肽是体液免疫中能够清除外来病原微生物的重要多肽。本研究通过Genome Walking技术从三疣梭子蟹基因组DNA中克隆得到两种抗菌肽基因　　ALF-7和Crustin-3的启动子区，经序列分析筛选出ALF-7含有NF-кB结合位点。启动子区的研究有助于构建双荧光素酶报告基因质粒以及Toll信号通路对抗菌肽的调控表达。