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珙桐起源古老,是我国特有的珍稀植物,因其濒危灭绝的状态,现在属于国家一级保护植物。开展珙桐的分子生物学研究,有利于珙桐的保护、生态与经济价值的开发。但是关于珙桐的研究主要集中在其生理、群落结构方面,分子方面的研究则相对较少。因此本研究基于 9 个基因片段(18S、26S、ITS、matK、rbcL、ndhF、trnS-trnG、trnL-trnF、rpl32-trnL),采用PCR直接测序法,对四川省18个县的珙桐材料进行序列测定,依据测序结果进行序列比对与亲缘关系分析,主要研究结果如下:(1)宝兴、都江堰、洪雅、汉源的珙桐材料在ITS、matK、rbcL、ndhF、trnS-trnG、trnL-trnF、rpl32-trnL这7个基因片段上都聚在一小支上,这表明这4份珙桐材料的亲缘关系较近。而峨边的珙桐材料与这4份珙桐材料在这7个基因片段上大都聚在一个大支上,表明峨边的珙桐材料与这4份珙桐材料亲缘关系相对较近,但有细微的进化差异。(2)碧峰峡和邛崃珙桐材料在 ITS、matK rbcL、ndhF、trnS-trnG、trnL-tr rnF、rpl32-trnL这7个基因片段上,都聚在一小支上,表明这二者亲缘关系较近。(3)沐川与天全的珙桐材料在matK rbcL、ndhF基因片段上在一小支中,在剩下的ITS、trnS-trnG、trnL-trnF、rpl32-trnL这4个基因片段中,都在一个大支中。这说明这二者之间有细微的进化差异,但是相对其余16份珙桐材料,它们之间的亲缘关系相对较近。(4)屏山和美姑的珙桐材料在rbcL、ndhF、trnL-trnF基因片段上聚在一小支上。在剩下的matK、ITS、trnS-trnG、rpl32-trnL这4个基因片段中,都在一个大支中。这说明这两份珙桐材料有细微的进化差异,但是相对其余16份珙桐材料,它们之间的亲缘关系相对较近。(5)珙县和北川的珙桐材料在matK、rbcL、ndhF基因片段上聚在一个小支上,在余下的ITS、trnS-trnG、trnL-trnF、rpl32-trnL这4个基因片段中,聚在一个大支上。这说明珙县的珙桐材料相对于其它珙桐材料,跟北川的珙桐材料亲缘关系最近。(6)筠连与雷波的珙桐材料在matK、rbcL、ndhF基因片段上聚在一个小支上,在ITS、trnS-trnG、trnL-trnF这3个基因片段中,聚在一个大支上。而在trnL-trnF基因片段上,它们不在一个大支上。所以二者亲缘关系还需要进一步的验证。(7)大邑的珙桐材料没有检测到trnL-trnF基因片段,但在其余用于聚类分析的6个基因片段中,均与碧峰峡、邛崃的珙桐材料聚为一支,这说明大邑的珙桐材料与碧峰峡、邛崃的珙桐材料亲缘关系相对较近。综上所述,本研究从分子水平上初步探究了四川省18个县的珙桐材料的亲缘关系,对于这些珙桐间的聚类与遗传分析有参考意义。通过DNA序列分析与形态学研究和细胞遗传学研究等组合,结合就地保护、提高珙桐种子的发芽率等,这样多方位的保护措施,才能有效保护珙桐的遗传资源、发挥其重要价值。