三江是指云南境内发源于青藏高原的怒江、澜沧江、金沙江,三江并流区则是哈巴雪山至担当力卡山、高黎贡山南麓至梅里雪山北端区域的简称,其具体经纬度范围是东经98°-100°30’,北纬25°40’-29°。因该区域地理位置特殊、自然环境复杂,孕育了极为丰富的生物,一直以来深受国内外学者关注。本文采用PPG I分类系统,基于云南大学植物标本馆蕨类标本室（PYU）丰富的石松类和蕨类馆藏标本,并广泛查阅了网络数字化标本及相关文献和资料,系统整理了三江并流区石松类和蕨类植物名录,并在此基础上进行了物种多样性、区系地理、水平和垂直布格局等方面的分析讨论,主要结果如下:1.三江并流区石松类和蕨类种类极其丰富,共有35科113属643种,是中国石松类和蕨类的重要组成部分。各流域石松类和蕨类种类分别为:独龙江流域30科95属363种,怒江流域34科104属402种,澜沧江流域20科54属276种,金沙江流域22科52属262种。其中,鳞毛蕨科、水龙骨科、蹄盖蕨科为优势科,鳞毛蕨属和耳蕨属为优势属。2.从科一级的分布来看,石松科、膜蕨科、碗蕨科和金星蕨科等生于湿热环境下的类群主要分布于独龙江流域和怒江流域,这与三江并流区自西向东水湿条件不断降低的变化规律相一致,相反,主要分布于干旱生境的凤尾蕨科则在澜沧江和金沙江流域分布较多。3.三江并流区属的区系成分以热带、亚热带为主,各流域热带、亚热带所含的属和所占的比例分别为:独龙江流域64属、怒江流域70属、澜沧江流域27属、金沙江流域26属,分别占各流域总属数的77.11%、78.65%、62.79%、65.00%。种的区系成分以东亚和中国特有成分为主,各流域东亚成分（中国-喜马拉雅）统计结果分别为:独龙江流域277种、怒江流域314种、澜沧江流域228种、金沙江流域209种,分别占各流域总种数的76.30%、79.09%、84.13%、81.84%。说明本研究区石松类和蕨类的起源与热带、亚热带植物区系有较密切的联系,但本质上属于东亚植物区系。属种的相似性系数分析结果表明:独龙江流域和怒江流域的联系较大,其次是澜沧江流域和金沙江流域联系较大,其他两两之间联系较小。此研究结果支持前人提出的怒江-澜沧江流域可以作为一条重要地理分界线的观点。三江并流区石松类和蕨类特有现象明显,共有161个中国特种,占整个区域石松类和蕨类的25%,其中,云南特有55种,怒江州特有12种,独龙江特有8种。4.物种丰富度沿海拔梯度变化的分析表明,三江并流区自西向东水分逐渐减少,不同流域分布不同植被类型,石松类和蕨类多样性沿海拔梯度呈现单峰型分布格局。其中独龙江流域季风常绿阔叶林中石松类和蕨类植物最丰富。怒江流域季风常绿落叶林、中山湿性常绿阔叶林和半湿性常绿阔叶林中石松类和蕨类植物最丰富。澜沧江流域常绿阔叶林、落叶阔叶林、针阔混交林和暖性针叶林等多种植被类型交替分布,石松类和蕨类的丰富度也较高。金沙江流域暖温性针叶林中石松类和蕨类植物的丰富度最高,主要为鳞毛蕨科为主。