构建坏死性凋亡相关预后模型在评估胰腺癌患者预后中的应用

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目的:探究坏死性凋亡在胰腺癌中的作用及预后价值,同时根据坏死性凋亡相关的基因构建预后模型评估患者的预后,并识别胰腺癌患者的风险亚群,探究不同组别间免疫微环境的差异。方法:胰腺癌转录组数据来自TCGA数据库、ICGC数据库和GEO数据库中的GSE85916。TCGA队列设为训练队列,ICGC和GSE85916队列设为验证队列。胰腺癌的单细胞测序数据来自GEO数据库中的GSE154778。通过加权共表达网络分析和单细胞测序分析,确定了与坏死最相关的基因。对这些基因进行COX回归和Lasso回归,并建立预后模型。通过计算风险评分,将胰腺癌患者分为NCPTS_high组(高风险组)和NCPTS_low组(低风险组),并进行生存分析、免疫过滤分析和组间突变分析。通过对临床样本的q RT-PCR检测进一步验证EPS8在正常和肿瘤中的表达。结果:本研究利用单细胞测序分析和转录组分析构建了胰腺癌的坏死相关模型。风险评分公式如下:NCPTS=POLR3GL*(-0.404)+COL17A1*0.092+DDIT4*0.007+PDE4C*0.057+CLDN1*0.075+HMGA2*0.056+CENPF*0.198+EPS8*0.219。通过这一模型,可以将不同队列的胰腺癌患者分为高风险组和低风险组,高风险组的预后明显较差。两组间免疫内滤水平和突变水平均存在显著差异。通过临床PCR检测EPS8的表达情况,发现EPS8在胰腺癌中的表达显著上调(*p<0.05)。结论:1)坏死性凋亡在胰腺癌中为预后的风险因素;2)结合单细胞测序和转录组分析的结果,构建了一个与胰腺癌坏死相关的预后模型。该模型可以有效地评价胰腺癌患者的预后,并为胰腺癌的治疗提供一定程度的临床参考;3)通过临床样本验证了模型中关键基因EPS8的在胰腺癌中的高表达。
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