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水稻分蘖是重要的产量性状,一直以来都是研究的焦点。经过科学家几十年的努力,终于在2003年的时候克隆到了控制水稻分蘖的关键基因MONOCULM1(MOC1),这是水稻分蘖研究的重大突破。水稻分蘖是决定株型的重要因素,但是对其驯化历史的研究却是一片空白。
研究表明MOC1基因编码一个属于GRAS家族的蛋白质,它表达与否直接决定水稻能不能分蘖,表达量的高低也在一定程度上决定分蘖数目的多少。而且MOC1突变还会影响花序的分枝状况。我们希望通过研究MOC1基因在水稻驯化过程中的多态性变化状况,探讨MOC1基因是否受到人工驯化的影响。
我们选择了一个可以代表水稻及其祖先野生稻多态性的群体展开对MOC1的研究,群体包括8份籼稻、7份粳稻、7份普通野尘稻和6份一年生野生稻。分析这个群体中的3500 bp的MOC1基因序列,发现MOC1在整个群体中都没有大的插入缺失变化。TajimaD检验和HKA检验结果都表明MOC1基因没有受到选择作用的影响。但是MOC1蛋白序列确实十分保守的,442个氨基酸中只有一个氨基酸残基位点是变异的。同时也发现,在水稻的两个亚种中,MOC1基因的多态性保留模式完全不同,籼稻高比例的保留了野生稻的多态性,而粳稻几乎丧失了所有的多态性。