本文以新疆地区古墓葬出土人骨材料的研究为出发点,结合历史学、考古学及民族学等方面的研究成果,对欧罗巴人种的“古欧洲类型”、“地中海东支类型”、“中亚两河类型”,与蒙古人种古代居民及其混杂类型的分布与迁徙情况作较为系统的分析归纳,探讨新疆历史上的楼兰、乌孙、车师、回鹘四个古国古民族的人种结构及其源流。本文的研究表明,古楼兰居民主要是地中海东支类型,他们是南帕米尔塞克东进到新疆后与当地人群融合的居民。乌孙人种的主体属于中亚两河类型,公元前二世纪西迁后,不断融入不同的部族,特别是蒙古人种的成分不断增加,形成了黄白两大人种的过渡类型——南西伯利亚人种,其基因的流向主要散布在哈萨克、吉尔吉斯等现代中亚民族之中。古车师人是欧罗巴人种与蒙古人种相混杂的民族,车师人种中不同的种系成分来源于不同的考古学文化,欧罗巴人种成分与西方文化(人群)进入新疆有关,蒙古人种来源于东部文化传统因素的影响,随着前、后车师的亡国,人种成分复杂的车师人融入到新疆的各古代民族之中。回鹘人的本体成分主要是北亚蒙古人种,公元840年后西迁回鹘一分为三,甘州回鹘在漫长岁月里发展演变为裕固族。高昌回鹘、葱岭西回鹘分别是西迁回鹘与当地中亚两河类型、地中海东支类型等人种的混血,随着塔里木盆地的回鹘化和伊斯兰化,经过漫长的融合过程,新疆地区的回鹘至元代形成了新的民族共同体近代维吾尔。欧罗巴人种、蒙古人种两大人类群体在新疆地区的交汇、融合,形成了许多由上述两大人种交融而生的混血族群,使得新疆各民族在遗传结构上带有浓郁的基因多态性、复杂性特点。