随着社会经济的发展，科学技术的支撑作用日益突显出来，各个国家也不断加大对科技资源的投入。而科研条件对于科技进步的支撑作用也越来越受到重视。农业科技对于解决中国“三农”问题，发挥着越来越重要的作用。而农业科研机构作为农业科技的排头兵，肩负着发展农业科学的任务，要发展农业科学，必须加大农业科技资源的投入。中央级农业科研机构是国家农业科技创新和发展的重要平台，其现有的科研条件资源和新增资源的配置问题就显得尤为重要。鉴于此，本文针对目前中央级农业科研机构科研条件资源配置中的问题，研究相关文献及理论方法，探索提高科研条件资源配置效率的途径。论文对科研条件资源配置进行了系统总结回顾，以中国农业科学院为案例进行实证分析，选取2006-2010年的数据，运用数据包络分析方法(DEA)对中央级农业科研机构科研条件资源的配置效率进行测度。在效率测度基础上，对影响科研条件资源配置效率的因素进行分析；同时，对不同改革类型科研机构的科研条件资源配置效率进行了分析。在上述研究的基础上，提出了有针对性的优化资源配置的对策建议。对中国农业科学院的实证分析结果表明：1．在2006-2010年间，科研条件新增资源与存量资源都稳步增加，为农业科研活动提供了物质保障。但是，科研条件资源布局不均衡程度较高，部分研究所科研条件资源基础雄厚，也吸引了更多的科研条件的新增资源。2．在2006-2010年间，全院科研条件资源配置效率保持稳定。3．各研究所技术效率与规模效率具有一定的差异：其中，作物所、畜牧所等8个机构纯技术效率与规模效率都为1；果树所和沼气所等4个机构纯技术效率达到1，而规模效率低于1；其他16个机构纯技术效率与规模效率值在0.230-0.998之间。4．对固定资产与修购资金作为科研条件资源存量与增量指标的分析表明：作物所、植保所等机构固定资产净值配置效率为1，环发所、蜜蜂所等7个机构的固定资产净值配置效率在0.752-0.935之间；作物所、植保所等机构修购资金配置效率为1，麻类所、特产所等14个机构修购资金配置效率在0.383-0.892之间。5．非营利性科研机构与拟转企科研机构的条件资源配置效率并没有显著差异。最后，本文提出了优化科研条件资源的对策建议：1．科研条件资源合理投入,以增量带动存量；激活存量，完善科研条件支持体系；2．促进科研条件资源的共建共享，提高科研条件资源的利用效率。