克螟稻cry1Ab基因LAMP检测方法研究

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近年来,许多转基因生物进入到中国市场,转基因生物对生态以及人类健康带来了潜在的危害。许多国家采取相应的措施加强对转基因生物和转基因食品的监管和标识,针对转基因成分的快速、灵敏检测也越来越重要、迫切。本论文以建立快速检测cry1Ab基因的LAMP方法为主要研究目的,为快速检测转基因植物以及转基因食品提供技术支持。环介导等温扩增(LAMP)检测作为一种新的核酸扩增法,具有反应温度恒定、特异性高和反应快速等特性。本研究以克螟稻中cry1Ab基因为模板设计LAMP特异性引物,同样区域设计常规PCR和荧光定量PCR引物用于构建作为阳性对照的重组质粒与比对实验。对建立的LAMP反应体系进行条件优化,确定其反应体系为:0.2mmol/L内引物(FIP&BIP),0.8mmol/L外引物(F3&B3),1.4mmol/LdNTPs,0.6M Betaine,8mmol/L MgSO4,10mmol/L KCl,20mmol/LTris-HCl,10mmol/L (NH42SO4,0.1%Triton X-100,8U Bst DNAPolymerase,1μL DNA模板,双蒸水补足25μL总体积。在65℃保温60min。实验结果可通过以下三种方式鉴定:直接肉眼观察白色沉淀或浑浊度变化;添加SYBR Green I荧光染料1μL,在紫外线照射下观察是否发出绿色荧光;琼脂糖凝胶电泳分析反应产物有无梯形条带。对设计的cry1Ab基因的LAMP引物做了特异性和灵敏度试验。实验结果显示,克螟稻品种检测呈阳性,而所有非转基因样品和其他转基因样品均为阴性,结果与常规PCR和荧光定量PCR法一致,说明LAMP引物特异性良好;以梯度稀释阳性对照重组质粒DNA为模板,LAMP检测法的灵敏度为3×102拷贝数,与荧光定量PCR法相同,高于常规PCR的灵敏度(3×105拷贝数)。植物基因组DNA快速提取方法的比较试验结果显示,Triton X-100法提取植物基因组DNA条带完整性更好,最接近试剂盒法提取的效果;并且Triton X-100法提取基因组DNA相对操作简单,适合于现场快速检测用基因组DNA的快速提取。在实际样品检测中, LAMP快速检测方法能检测出转基因成分为0.25%的混合的基因组DNA样品,能从克螟稻不同组织中检测出cry1Ab基因,结果与荧光定量PCR法一致。通过在LAMP反应体系中添加金属荧光指示剂钙黄绿素(calcein)和氯化锰,建立了克螟稻cry1Ab基因的可视化LAMP快速检测方法。其中,最优化的金属荧光指示剂的终浓度为:10μM calcein,0.5mM MnCl2。反应结果可以通过直接观察反应液的颜色变化来判断。可视化LAMP检测cry1Ab基因的特异性和灵敏度试验结果表明,克螟稻品种检测的特异性良好;灵敏度为3×103拷贝数的阳性对照重组质粒DNA。研制了克螟稻cry1Ab基因的可视化LAMP快速检测试剂盒,保质期在4个月以上。在实际样品检测中,克螟稻cry1Ab基因的可视化LAMP快速检测方法能检测出转基因成分为0.5%的基因组DNA样品,并对4种转基因种粉末样品中cry1Ab基因进行检测。结果表明:BT11玉米粉中检测出约2.5%的cry1Ab基因成分,GT73油菜籽粉不含有cry1Ab基因成分,MON810玉米粉检测出1-2.5%的cry1Ab基因成分,BT176玉米粉检测出约1%的cry1Ab基因成分,结果与荧光定量PCR法和普通PCR法一致。本研究分别建立了克螟稻cry1Ab基因的LAMP快速检测方法与克螟稻cry1Ab基因的可视化LAMP快速检测方法,研制了cry1Ab基因的可视化LAMP快速检测试剂盒,实现了现场快速检测的目标。该方法特异性强,灵敏度高,检测时间短,为转基因植物以及转基因食品中cry1Ab基因的检测提供了一个新的检测技术平台,为检测机构推广此技术提供了技术支持。
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