随着现代科学技术的飞速发展和知识经济时代的到来,科技园区作为聚集创新力量的重要载体,在通过技术进步带动经济发展方面的有效性和重要性日益显现。本文借助协同学相关理论,采用理论分析与实证分析相结合的方法,探讨科技园区系统协同机制的形成与运行规律,通过对科技园区系统的协同机制的研究,为我国科技园区系统建设提供一种全新的发展思路,对提高我国科技园区系统整体协同效应具有积极的指导意义。首先,在对国内外科技园区理论、科技园区发展机制、科技园区发展评价等领域的研究现状进行了细致总结和评述的基础上,本文提出了科技园区系统协同机制分析的框架,阐述了科技园区系统的内涵与构成,并对科技园区系统协同机制的内涵及构成要素进行了分析,给出协同机制研究的分析逻辑和分析内容。创造性地界定了科技园区系统——是由园区子系统、校区子系统、社区子系统三位一体的有机组成,并提出了基于前提条件——过程实现——结果评价为主线的协同机制分析框架,拓展了科技园区系统理论研究的视阈和方法。其次,在协同条件机制分析部分揭示了科技园区系统协同演化的耗散结构条件,论证了科技园区系统具备开放性、远离平衡态、非线性、涨落等形成耗散结构的四个前提条件。然后通过引入熵概念来定义系统的有序程度,对正负熵如何量化进行了公式演绎,并构建了基于熵流量化的系统耗散结构判别工具——布鲁塞尔器模型,为科技园区系统协同演化的实现提供了条件论的支持；在协同实现机制分析部分剖析了科技园区系统的协同实现机理,指出在动力、管控、保障三个子机制作用下,科技园区系统中的园区、校区、社区三个主体角色间在自组织演化过程中产生系统的序参量——子系统协调程度,聚焦了系统演化过程中的关键量度；在协同评价机制分析部分采用数量化和模型化的分析方法构建了科技园区系统协同绩效评价模型,操作层面的指标体系构建过程中借鉴了平衡计分卡的核心思想,并选取模糊积分综合评价方法为评价工具。最后,研究选取了哈尔滨工程大学科技园区系统这一典型为实证分析对象,在进行了协同绩效定性评价之后,归纳总结了系统存在园区产业聚集效果欠佳、校区创新引领作用不够、社区服务支撑能力不强等问题,分析并找出制约哈尔滨工程大学科技园区系统发展问题的根源性成因。并以本文构建的科技园区系统协同机制框架为指导,为哈尔滨工程大学科技园区系统协同机制的重构提出相应的对策。