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利用18S rRNA基因序列分析方法，对我国的河北、辽宁两省以及甘肃省的临潭和宁县四个不同地区羊的巴贝斯虫进行分子分类学研究。用分离于四个地区的羊的巴贝斯虫感染实验动物，自感染羊的红细胞或全血中提取基因组DNA，根据GenBank中已发表的巴贝斯虫18S rRNA序列设计两对羊巴贝斯虫特异性引物，通过PCR扩增目的基因片段，将扩增产物连接到PGEM-Teasy载体中，经酶切鉴定，PCR分析，进行序列测定，结果显示羊巴贝斯虫四个分离株的18S rRNA基因大小为1800bp左右。利用DNAStar对实验所获得的这四株羊的巴贝斯虫和GenBanl(中部分巴贝斯虫和泰勒虫的18S rRNA基因进行比较分析，建立两个进化系统发生树。结果发现自河北、辽宁、临潭、宁县四个地区分离株建立的进化树上，临潭与宁县的虫株亲缘关系较近，同源性是91.4％；而辽宁与河北的同源性是95.8％。当引入基因库中其它巴贝斯虫与泰勒虫的18S rRNA基因后建立进化系统发生树时，发现辽宁、临潭、宁县三个地方的虫株亲缘关系较近，且位于分歧巴贝斯虫与双芽巴贝斯虫之间，而河北分离的虫株则位于双芽巴贝斯虫与马的驽巴贝斯虫之间。