分子标记技术在高粱属6个近似种的亲缘关系分析及其种籽识别中应用

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1 高粱属(Sorghum)DNA提取方法的研究 采用CTAB法、SDS法、CTAB-SDS法及TaKaRa法等4种方法提取高粱属6个近似种(假高梁、黑高粱、丝克高粱、拟高粱、苏丹草和明福1号)种子的DNA,并对不同提取方法所获取的DNA的纯度、质量浓度及DNA提取率研究分析比较,建立微量提取高粱属DNA方法——CTAB-SDS法。2 高粱属的6个近似种的rDNAITS区基因序列的研究 6个近似种的rDNA ITS区基因序列的测定与变异位点的分析结果表明:假高粱及其同属的5个近似种的ITS区基因序列的长度范围为588~589bp,G+C百分含量为60.27~61.05%,其中ITS1长度为207~208bp,G+C百分含量为53.91~61.54%;5.8S rDNA为164bp,G+C百分含量为56.10~58.54%;ITS2为217bp,G+C百分含量为66.36~67.28%。利用Jaccard相似系数,采用UPGMA聚类法,建立系统间的亲缘关系图。对6个种的ITS(ITS1+5.8S+ITS2)、ITS1、ITS2、5.8S的各个不同区段的序列的分析结果表明,利用ITS序列对它们的亲缘关系的分析比其它三个区段的序列分析更为准确:明福1号与拟高粱之间的相似系数均比其与其它4个近似种之间的相似系数大,证实明福1号是利用野生的拟高粱驯化培育出来的牧草,从而明确了明福1号分类和检疫地位。3 快速检测假高粱及其近似种DNA的分子标记方法的研究 6种限制性内切酶对假高粱及其同属近似种的rDNA 18S-26S区部分基因片段的酶切分析结果表明:不同的限制性内切酶对假高粱及其近似种的18S-26S区的PCR扩增产物的酶切反应的结果不同,其中,限制性内切酶 Nae Ⅰ-PmaC Ⅰ或AflⅢ可检测假高粱,Xce Ⅰ可检测丝克高粱,BspH Ⅰ可检测明福1号,Cfr Ⅰ可检测明福1号、拟高粱。
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