目的了解深圳市龙岗区成蚊携带虫媒病毒的情况，探讨相关病毒株的分子流行病学特征，为蚊媒传染病的预防与控制提供依据。方法2009~2011年，在龙岗区的龙城、南湾、坂田等10个街道及21个大运场馆室内外环境设立监测点，按照《全国病媒生物监测方案》监测方法采集成蚊标本。采用SYBR GreenⅠ实时荧光RT-PCR进行乙脑病毒（Japanese encephalitis virus，JEV）、登革病毒（Dengue virus，DV）和Nam Dinh病毒（Nam Dinh virus，NDiV）等虫媒病毒的检测，分析成蚊病毒感染情况；用C6/36与BHK-21细胞进行相关病毒的分离工作，以TaqMan-MGB实时荧光RT-PCR与基因扩增技术进行病毒鉴定。测序基因扩增片段，用ClustalX、Mega4、DNASTAR等软件对测序结果进行同源性分析与构建系统进化树。结果共采集成蚊25556只，隶属3属7种，分别是按蚊属的中华按蚊、微小按蚊、嗜人按蚊；库蚊属的三带喙库蚊和致倦库蚊；伊蚊属的东乡伊蚊和白纹伊蚊。致倦库蚊23962只，为优势蚊种，占93.8%；东乡伊蚊637只，占2.5%；白纹伊蚊有408只，占1.6%；三带喙库蚊385只，占1.5%；其他种类占0.6%。SYBR GreenⅡ实时荧光RT-PCR检测结果显示，有2批致倦库蚊和1批三带喙库蚊标本检出乙脑病毒核酸阳性，白纹伊蚊和东乡伊蚊标本各1批检出登革病毒核酸阳性；4批致倦库蚊标本检出Nam Dinh病毒核酸阳性。4批NDiV核酸阳性标本能引起C6/36细胞出现典型的细胞病变（CPE），但不引起BHK-21细胞的病变。SYBR GreenⅠ实时荧光PCR检测JEV和DV核酸阳性的标本接种C6/36细胞和BHK-21细胞后，未能分离到相关病毒。用TaqMan-MGB实时荧光RT-PCR检测NDiV分离物中病毒核酸随时间推延的增殖情况，检测结果显示0天、3天、6天、9天分离物的Ct值呈梯度减少，表明随分离时间的增加，培养液中病毒核酸含量同步递增。对4株深圳NDiV进行RdRp基因和部分ZmHel1基因的扩增，扩增产物在2%琼脂糖电泳均出现目的条带。4株分离株RdRp基因核苷酸序列间同源性在99.8~100.0%之间，氨基酸序列同源性为99.7~100.0%；深圳分离株的RdRp基因核苷酸和氨基酸序列与越南代表株NDiV（02VN178）的同源性均达99%以上；系统进化树分析，深圳NDiV分离株与越南NDiV代表株的亲缘性最近，同属一个进化分支。结论本研究首次在深圳市龙岗区开展全面的虫媒病毒传播媒介的监测，证实了致倦库蚊为当地的优势蚊种。在采集的成蚊标本中检测到JEV和DV核酸，提示病毒存在低水平的自然循环，当地有可能是乙脑、登革热的自然疫源地。继2011年全球首次在越南发现蚊传套式病毒-NDiV后，本研究发现深圳市致倦库蚊中携带该病毒，这是中国国内首次发现NDiV[1]，进化树分析显示深圳NDiV分离株与越南分离株在遗传进化学上存在联系。