“主制造商-供应商”模式下的主制造商已经摆脱了传统的制造角色，而以管理者的身份参与到供应商的合作中去，这种合作模式更强调供应链上各企业的协同运作，实现供应链各环节的“无缝对接”来提升合作的整体绩效。研究“主制造商-供应商”模式的协同合作关系，对推动大型复杂产品制造行业的发展具有重要的现实意义，本文基于系统的视角，应用协同学理论对“主制造商-供应商”协同合作关系和基于协同关系的利益分配进行了初步的研究。论文首先系统地阐述了协同学基本原理、“主制造商-供应商”模式相关概念及内涵以及主制造商与供应商协同合作关系特征及形式，构建了协同合作的主体组织框架；然后对主制造商与供应商的协同合作关系的演化机理做了详细探讨，通过分析影响系统协同合作利益流动的五个要素，确定了系统协同序参量的形成过程，并详细阐述了系统自组织作用、序参量的形成与系统内部利益流动三者之间的相互作用关系，引出了系统合作协同度；接着论文分析影响系统合作协同度的相关因素，构建了主制造商与供应商协同度测定的评价指标体系，并建立合作协同度测定的评建模型；结合相关理论设计了基于协同度的系统利益分配模型，探讨了协同度与贡献系数、利益分配系数等参数之间的关系，通过模型求解总结出关于协同合作的一些重要结论。最后，论文结合案例对XXX企业主制造商与供应商之间协同合作的现实情况进行了研究，测定了该企业在不同时间段内主制造商与供应商协同度的大小，并结合利益分配模型对各企业利润分配情况进行数值求解，针对求解结果中协同度变化趋势与利益变化趋势之间的关系进行了充分的解释；论文最终总结了本文的研究结论，并展望了未来的可行性研究。