论文部分内容阅读
尼氏真绥螨作为在我国南部广泛分布的捕食螨,是许多种害螨的重要天敌。本研究中,COI和ITS被用来研究尼氏真绥螨10个地理种群间的遗传分化。我们首先检测了中国尼氏自然种群核苷酸变异的水平和模式,探明了这些种群间是否有遗传分化。最后,我们还评价了DNA序列数据研究种群遗传的实用性。主要结论如下：(1)COI片段长度为658bp,共有46个多态性位点,将全部序列分类为33个单倍型。序列AT碱基含量较高,变化范围为65.4%到66.5%。COI基因的核酸多样性(nucleotide diversity,π)以及单倍型多样性(haplotype diversity, hd)较高,变化范围分别为0.0034到0.0111和0.385到0.809。多样性较高的为重庆(π=0.1111;hd=0.809)和广州种群(π=0.01022; hd=0.788)。Tajima’s test检测显示COI区域没有显著偏离中性平衡。西南种群中重庆拥有最多的单倍型(7个)。单倍型CH29分布频率最高,分布于五个种群。有单倍型与种群的特异性分布现象(单倍型CH02和CH03仅分布于成都种群,CH06和CH07仅分布于广州种群)。COI单倍型网状分支图比ITS复杂。(2)从145个样品成功扩增出了ITS,片段长度有648和649bp两种,共有16个多态性性位点,其中9个为转换(transition),6个为颠换(transversion),1个位点为缺失(indel),将全部序列分为16个单倍型,其中有11个为私有单倍型。ITS序列总体的核酸多样性(nucleotide diversity,π)为0.00136。广州种群的ITS遗传多样性较低,只有1个单倍型被发现。成都种群的ITS遗传多样性较高(π=0.00185, hd=0.803)。Tajima’s test检测显示ITS区域负显著偏离中性平衡(Tajima’s D:-1.77962, P<0.05). IH02分布于所有种群,频率最高。有些单倍型只分布于特定种群,如IH05只分布于韶关种群,IH09、IH10、IH15只分布于成都种群。成都种群是异质性最高的种群,拥有6个单倍型。南宁和长沙种群次之,分别具有5个单倍型。ITS单倍型的网状图较为简单。单倍型间最多的碱基差异为2个。(3)多数种群间的FST值显示种群差异显著。COI区域的种群间的FST值变化区间是-0.03858(武汉-南平)到0.71485(成都-韶关)。ITS区域的种群间的FST值变化区间是-0.04776(南平-长沙)到0.42424(南平-广州)。从COI序列得到的FST值明显高于ITS。在长沙、武汉、南平种群间没有显著性差异(除了武汉-长沙,基于COI序列)。在COI区域,种群间的FST/(1-FST)值与地理距离显著正相关(r=0.303,P=0.047),而ITS种群间FST/(1-FST)与地理距离没有显著相关性(ITS:r=0.011,P=0.441).我们对比了基于COI和ITS序列的NJ法构建的进化树和PCA分析结果(COI:PC1=33.74%,PC2=21.74%;ITS:PC1=74.53%,PC2=15.84%),显示尼氏真绥螨在中国拥有至少3个分支。