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目的检测MUC3,MUC4在肝内胆管结石并肝内胆管癌组织中的表达，研究其与肝内胆管癌的临床病理指标及预后的关系。材料与方法收集湖南省人民医院2006年6月-2010年6月间因肝脏外伤及肝血管瘤行手术切除的正常胆管组织标本，肝内胆管结石行肝叶切除术的胆管标本，肝内胆管结石并肝内胆管癌行肝叶切除术的胆管标本进行研究。应用免疫组织化学方法检测石蜡标本中MUC3、MUC4表达情况，应用免疫印迹方法检测新鲜标本中MUC3、MUC4表达情况；以SPSS17.0统计软件分析各组织中MUC3，MUC4与肝内胆管结石并肝内胆管癌患者临床病理指标，生存时间之间的相关性。结果(1) MUC3在三种胆管组织中的表达有差异（P=0.005），MUC3在正常胆管中的表达阳性率高于肝内胆管癌，差异有显著性(P<0.01)。肝内胆管癌中MUC3蛋白的表达与组织分化程度、淋巴结转移等有统计学意义(P<0.05)，与患者年龄、性别、肿瘤大小、有无门静脉浸润无统计学意义(P>0.05)。（2）MUC4在三种胆管组织中的表达有差异（P=0.000），MUC4在正常胆管中的表达阳性率低于肝内胆管癌组，差异有显著性(P<0.01)。肝内胆管癌中MUC4表达与组织分化程度、淋巴结转移、有无门静脉浸润有统计学意义(P<0.05)，与患者年龄、性别、肿瘤大小无统计学意义(P>0.05)。（3）肝内胆管癌中MUC3阳性表达患者中位生存率高于MUC3阴性表达患者；MUC4阳性表达患者中位生存率低于MUC4阴性表达患者。（4）肝内胆管癌患者中，MUC3表达，MUC4表达，淋巴结转移，门静脉侵润作为一项独立因素影响患者预后，而性别，年龄，肿瘤大小，组织分化程度不影响患者预后。结论：（1）肝内胆管结石合并肝内胆管癌组织中MUC3，MUC4蛋白出现异常表达；MUC3表达下降及MUC4表达增高可能在以肝内胆管结石为诱因的肝内胆管癌发生过程中起到促进作用；（2）MUC3表达，MUC4表达可能是影响肝内胆管结石合并肝内胆管癌患者预后的独立因素，MUC3高表达可能预示着预后较好，MUC4高表达可能预示着预后不良。