残疾人就业问题是社会无法避免的现实问题,残疾人就业保障金制度是残疾人就业的重要制度安排。残疾人就业保障金制度自确立以来,对残疾人及社会都发挥了重要的作用,但随着残疾人就业保障金制度的不断实施以及残疾人数量的不断扩大,该项制度也日益凸显出其管理中所存在的问题。在考察残疾人就业保障金制度的历史和现状的基础上,发现残疾人就业保障金存在征收力度不够、支出比例不合理、基金没有进行适当的投资、基金监管缺位等系列问题。这些问题主要是由于法规的不完善、管理意识滞后和管理措施落后等原因所造成的。针对上述所存在的问题,结合社会保障基金管理理论,从系统分析的角度提出了政策建议。首先,优化残疾人就业保障金管理的法制环境;其次,加强宣传,改变单一缴费率并对现行的代征工作进行考核以提高征收率;第三,扩大基金支出范围并确定合理的支出比例,尤其是要降低机构经费和代征费;第四,实行省级统筹、市级执行的管理模式,并逐步投资以实现基金的保值增值;第五,构建司法、行政和社会三位一体的监督体制。