2015年修订后的《环境保护法》规定提起环境公益诉讼的主体资格,也成为我国环境公益诉讼制度的开端,在实践中进行了诸如设立专门环境法庭、联合出台协作意见等方式进行了有益探索,然而目前以行政区划为基础的地域管辖不适应环境跨区域生态问题的解决。本文旨在提出跨区域环境公益诉讼协同治理的对策和方法,以期完善现有环境公益诉讼的理论框架和治理路径。第一部分概述了跨域环境公益诉讼和协同论的概念及功能,为应用协同论解决跨区域环境公益诉讼问题提供理论基础和可行性依据。跨域环境公益诉讼具有跨域性、整体性、复杂性的特点,兼具预防与救济、整合协调的重要功能。协同论因其广泛适用性、强大的协调与整合效应,引入复杂、开放的环境公益诉讼系统具有可行性与必要性。第二部分通过搜集司法案例、文献研究、实证调研等方式总结目前跨区域环境公益诉讼存在的争议问题并进行原因分析。跨区域环境公益诉讼面临冲突解决机制及标准各异、管辖权限制、调查取证与鉴定难、诉讼目的实现效果差的问题。导致上述问题的原因可以概括为法律及监督机制不完善、地方保护主义盛行、怠于履行职责、协作机制松散。第三部分,国内外探索跨域环境协同治理的经验借鉴。探析密西西比河、莱茵河流域治理的模式,总结国内京津冀、长三角地区以及跨区域集中治理的经验,借鉴在主体协同、机构协调、统一规则等方面的有益经验。第四部分,提出建立环境公益诉讼跨区域协同制度的路径。首先,达成协同治理共识和标准。要统一绿色发展、整体协同、政绩考核的思想理念并制定跨区域综合规划。其次,打造跨域多元治理共同体,形成政府主导、企业发挥主体作用、公民与社会组织积极参与的良好局面。再次,构建协同环境治理的法律保障、协作、专业化治理机制。法律保障机制包括明确集中管辖、提供调查取证与鉴定保障、设立环境法庭。协作机制涵盖设立跨域环境治理协调机构、协调整合各级政府及部门之间合作、加强与法学研究所、法学院合作。专业化机制主要加强高科技环境技术的应用和开发、培养环境技术评估专业化人才。最后,关注环境治理效果。主要包括设立环境公益诉讼办案范本与实现生态治理效果可视。