Plipastatin非核糖体肽合成酶系的组合生物合成及新型脂肽的合成规律研究

来源 :南京农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:catchersun
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
芽胞杆菌属(Bacillus)分泌的脂肽类物质具有抗细菌、抗真菌、抗病毒和抗肿瘤等生物活性,甚至对一些多重耐药的致病菌也有良好的抑制效果。Plipastatin,又称Fengycin对真菌、尤其是丝状真菌具有较强的抑制活性,常被应用于植物根、叶致病菌的生物防治和采后果实(苹果、桃)的保鲜及饲料的储藏和防腐,减少因真菌毒素积累而造成的危害。由于脂肽类物质在农业、食品防腐保鲜领域的应用潜力和价值,开展脂肽合成代谢研究,挖掘抑制食源性致病菌的新型抗菌脂肽类物质具有重要的研究意义和价值。较传统的通过微生物发酵、分离纯化、物理或化学诱变方法获取新型脂肽相比,利用组合生物合成对脂肽非核糖体肽合成酶系改造修饰,生成新型脂肽类物质,可以充分发掘和开拓微生物基因资源,极大地丰富天然脂肽产物库,为天然绿色食品防腐剂的筛选拓宽来源。本论文主要通过基因工程技术将一株不产脂肽类物质的模式菌株B.subtilis pB2改造成联产脂肽类抗生素Surfactin和Plipastatin的工程菌株,采用菌体细胞微观结构观察、流式细胞仪和激光共聚焦测定细胞骨架等技术研究了 Surfactin和Plipastatin分别对食源性致病菌金黄色葡萄球菌和农产品致病真菌尖孢镰刀菌的影响。同时采用硫酯酶TE前移、亚基PPSE前移和模块及单个结构域敲除三种不同的组合生物合成策略对Plipastatin合成酶系进行修饰,获得并鉴定了一系列新的脂肽衍生物,探索了 TE硫酯酶在生物体内选择性催化水解和环化的能力,探讨了 COM结构域的选择性互作对新Plipastatin杂合酶系统装配线的影响,探索了模块和结构域的缺失对NRPS装配线的功能影响。主要研究结果分述如下:1.Surfactin和Plipastatin联产菌株B.subtilis pB2-L的构建及抑菌效果研究将一个由组成型启动子(P43)、功能基因(sfp)和多效调控基因(degQ)组成的基因表达框通过同源重组原理整合至不产脂肽类物质的模式菌株B.subtilis pB2基因组的amyE位点上,获得了一株Surfactin和Plipastatin联产的工程菌株B.subtilis pB2-L。使用液相质谱串联技术,在pB2-L菌株的脂肽粗提液中鉴定出了含有C14-21饱和脂肪酸链和C14-18不饱和脂肪酸链的Plipastatin,及其碳链长度为9~18的Surfactin和C12-16的线性Surfactin。采用扫描和透射电子显微镜、细胞骨架分析和流式细胞仪研究了脂肽Plipastatin和Surfatin分别对微生物细胞的影响。研究结果表明,来自pB2-L菌株的Plipastatins通过促使细胞形态畸形化、细胞内容物空泡化和破坏细胞骨架导致丝状真菌尖孢镰刀菌细胞生长抑制和细胞死亡,其最小抑菌浓度(MIC)为16 μg·mL-1;而Surfactins则通过破坏金黄色葡萄球菌的细胞膜,造成胞内核酸泄露,导致细胞死,其最小抑菌浓度为20 μg·mL-1。基于工程菌株方便的遗传操作,本研究为探索脂肽Plipastatin合成酶的组合生物合成,催化新型脂肽衍生物合成奠定了基础。2.硫酯酶TE结构域前移修饰与新型脂肽的合成将脂肽Plipastatin合成酶系末端的硫酯酶TE结构域前移至Module 7、8和9的T结构域末端,分别采用 7ProT-C linker、8GlnT-C linker 和 9TyrT-E linker 连接,获得了相应的突变菌株LP1、LP2和LP3。高分辨LC-ESI-MS结果显示,菌株LP1、LP2和LP3均不能生产Plipastatin和其相关衍生脂肽。采用10IleT-TE linker分别连接Module 7、8和9的T结构域与硫酯酶TE,分别获得了突变菌株LP4、LP5和LP6。高分辨LC-ESI-MS/MS结果显示,突变菌株LP4能生产新型的线性脂七肽和环七肽,其结构分别为:C16-19β-OHFA-E-O-Y-T-E-V-P 和 C16-19β-OHFA-E-O-cyclo(Y-T-E-V-P);LP5能生产新型的线性脂八肽和环八肽,其结构分别为:C16-17ββ-OHFA-E-O-Y-T-E-V-P-Q和 C1719β-OHFA-E-O-cyclo(Y-T-E-V-P-Q);LP6 能生产新型的线性脂九肽C15-17β-OHFA-E-O-Y-T-E-V-P-Q-Y,及其线性脂八肽和环八肽。本研究发现了在新构建的杂合酶系中,硫酯酶TE结构域具有相对宽松的底物选择性,且10IleT-TE linker序列是酶系催化脂肽产物合成是必不可少的。3.酶亚基PPSE前移和COM替换修饰与新型脂肽的合成将Plipastatin合成酶系中的酶亚基PPSE前移至PPSB末端,产生的突变菌株LP7能够按照新设计的装配线(PPSA-B-E)合成新型脂肽衍生物环五肽,其结构为:C16-18β-OHFA-Glu-Orn-cyclo(Tyr-Thr-Ile),该结果证明了蛋白通讯供体域 COMdppsB与非同源的受体域COMappsE进行相互通讯交流。将亚基PPSE前移至PPSC末端,产生的突变菌株LP8失去了合成相关脂肽衍生物的能力,该结果表明亚基PPSC末端的蛋白通讯供体域COMdppsC不能与非同源的受体域COMappsE兼容,不能相互交流互作。采用原始兼容和匹配的COMdppsC/COMappsD替换不兼容的COMdppsC/COMappsE,产生的突变菌株LP9合成了截断的脂六肽,其结构为:C16-17β-OHFA-Glu-Orn-Tyr-Thr-Glu-Ala/Val;采用COMdppsD/COMappsE替换,产生的突变菌株LP10合成了新型的线性七肽产物,其结构为:C17-18β-OHFA-Glu-Orn-Tyr-Thr-Glu-Ala-Ile。4.模块和结构域缺失修饰及新型脂肤的合成分别缺失Plipastatin合成酶系中的Module 6和7,导致形成的相应突变株BM6和BM7均丧失了合成Plipastatin相关脂肽的能力。分别缺失Module 7中单个A结构域和T结构域,形成的相应突变菌株BA7和BT7均能生产截断的线性六肽产物,其结构为:C16~17β-OHFA-Glu-Orn-Tyr-Thr-Glu-Ala/Val。缺失 Module 6 中的单个 T 结构域,形成的突变菌株BT6则不能生产Plipastatin相关脂肽;而缺失Module 6中的单个A结构域,形成的突变菌株BA6则能产生三种类型的新型Plipastatin衍生脂肤产物,分别为线性五肽(C16-17β-OHFA-Glu-Orn-Tyr-Thr-Glu)、线性六肽(C16-17β-OHFA-Glu-Orn-Tyr-Thr-Glu-Ile)和线性八肽(C16-17β-OHFA-Glu-Orn-Tyr-Thr-Glu-Gln-Tyr-Ile)。本研究首次揭示了 Plipastatin杂合酶系在脂肽产物装配过程中呈现的模块跳跃现象,为将来脂肽合成酶改造催化脂肽多样性的形成提供了一个新的视野。
其他文献
<正> 西安是唐诗的故乡。西安是旅游胜地。若是将唐诗与旅游更紧密地结合起来,岂不锦上添花,岂不更好? 陕西省委副书记、西安市委书记袁纯清同志近年来多次提出在城市建设与
会议
近年来,随着我国生物食品技术的快速发展,也为身份自动化识别提供了更加先进、科学的技术方法,以人脸识别技术为例,该技术近年来在智慧楼宇中应用十分广泛,且效果显著,本文主
<正>4部著作李鹏从2004年到2006年,出版了《众志绘宏图——李鹏三峡日记》、《起步到发展——李鹏核电日记》、《电力要先行——李鹏电力日记》、《立法与监督——李鹏人大日
期刊
<正>传统市场营销的关注点是市场营销、拉新、获客,或者产品的曝光度、知名度,而增长黑客拓展到了用户的整个生命周期。做增长不是一件容易的工作,因为做增长,你每天面临的变
<正>今天的数学课,是孩子在认识了1-10后认识11-20的数。其实目前一年级的孩子,在没有学习之前看到11-20中任何一个数都可以很快地读出来,并对数的顺序及大小都有一定的掌握,
<正>2020年11月16日至17日,中央全面依法治国工作会议在北京召开。这次会议最重大的成果,就是确立了习近平法治思想,强调习近平法治思想内涵丰富、论述深刻、逻辑严密、系统
干旱区的湿地,不仅是该区域重要的水资源、环境资源,而且是举足轻重的旅游资源,这对于干旱区的环境、经济、社会的可持续发展至关重要。但干旱区湿地的生态环境非常脆弱,随着
一、互联网及网络文艺的现状互联网问世二十年时间,业已迅速覆盖全球,对人类社会产生了深刻的革命性改变。信息化,作为当今世界对人类社会生产和生活方式影响最为深刻、对世
文章基于政策评估理论,从投入和产出两个方面构建长三角区域高新技术产业高质量发展的政策评估模型,以长三角26个城市2014年到2018年高新技术产业为研究对象,运用熵值法和数
托克逊县是新疆花生的主产区,为满足市场需要,引进5种花生品种,以托克逊花生作为对照进行品种对比试验,从中筛选出适宜托克逊县种植的优质高产的新品种,为托克逊县花生优质、