在我国特殊的审计市场条件下,探寻对审计收费有显著影响的重要因素,具有一定的理论意义和现实意义。金融机构在国家经济中处于核心地位,具有其自身的特点,金融类上市公司与非金融类上市公司在财务状况、经营成果和现金流量等方面存在较大差异,金融审计是对金融机构风险进行监督的重要手段,直接关系着国家的金融安全。审计费用是审计风险大小的反应,通过研究审计费用与审计风险的关系,可以发现金融机构的哪些风险较大,以便有针对性的重点监管和防范。目前,我国关于金融审计的实证研究还不是很多。因此,金融审计和审计收费研究是审计研究中一个非常重要的领域。本文在回顾相关文献和对审计收费影响因素的理论分析基础上,构建了适合我国审计市场的审计收费模型,基于上市公司2004-2010年的面板数据,采用固定效应模型、广义最小二乘法以及有序logistic模型,识别了金融类与非金融类公司审计费用影响因素的差异,实证研究了非金融类公司和金融类公司审计费用的影响因素的不同,从定量的角度为金融审计的研究提供了全新的思路。研究发现：流通股比例与非金融类公司审计费用正相关,与金融类公司的审计费用负相关；审计师变更对非金融类公司审计费用无明显影响,与金融类上市公司审计费用正相关；资产负债率与非金融类公司审计费用正相关,与金融类公司审计费用负相关；而公司规模、净资产收益率、上市公司上市年限、是否由国内“十大”审计、前十大股东持股比例、上市公司所在地、第一大股东是否为国有股、第一大股东是否以集团形式存在等因素对这两类公司审计收费的影响没有显著差别。因此,要加强金融机构的审计应从控制流通股比例、是否更换审计师和改善公司资本结构这几个方面重点投入。