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本实验以四川农业大学玉米研究所选出的籽粒深度和大小不同的16个高代稳定自交系和4个外引骨干系为供试材料，按Griffing方法4组配190个杂交组合，通过自交系农艺经济性状鉴定，双列杂交分析和基于SSR分子标记的聚类分析，对16个新选自交系进行自身农艺经济性状分析，配合力分析和杂种优势群的划分。同时，对粒长、粒宽、粒厚、收获时籽粒含水量的遗传特性进行初探。结果表明： 1．方差分析表明，20自交系在株高、穗位高、穗长、秃尖长、穗行数、行粒数、单株产量、百粒重、粒长上存在极显著差异，综合分析16个新选系的株高、单株产量及其构成性状，结果表明R08、50732、50413、52891、50242、ES40和18599是农艺经济性状表现较好的新选系；株高、穗位高、播种至抽丝间隔、穗长、秃尖长、穗行数、行粒数、穗粒数、百粒重、容重、出籽率、穗重、轴重、单株产量、籽粒鲜干重差（HKWI）、粒长、粒宽、粒厚等性状在190个杂交组合间存在极显著差异，单株产量超过对照品种川单13及川单21 10％以上的杂交组合分别为10个和6个。 2．配合力方差分析结果表明，各性状一般配合力（GCA）和特殊配合力（SCA）在不同亲本、组合间存在极显著差异；单株产量及其构成性状GCA表现较好的新选系有40972、R08、50242、52202、ES40、40221，单株产量SCA效应值达正向显著或极显著的组合有52个，达负向显著或极显著的组合有41个，单株产量SCA最高的组合是52891×50642，单株产量SCA最低的组合是50732×6983；单株产量SCA的方差变幅为93.70～324.34，方差较小的新选系是52272、4146、R08，方差较大的新选系是50642、50732、52533；单株产量TCA排在前30位杂交组合，其中有17个组合含有40972或50242这两个新选自交系。综合分析新选系农艺经济性状表现和配合力表现，笔者认为40972和50242综合表现最好，不仅单株产量GCA高，而且单株产量SCA方差的变异幅度较大，用其组配的组合TCA也高，且出现机率大，从中筛选到高产杂交组合的可能性大，应当充分加以利用，但40972自身产量较低，且株高GCA正向效应值较大，所以在组配时宜作父本，并注意母本株高GCA的选择；其余新选系各自有其突出的优良特点，可根据育种要求加以利用。 3．根据SSR分析结果，计算20个供试自交系的遗传距离，平均遗传距离为0.82，变异幅度为0.11-1.26，其平均值虽较小，但变异幅度却较大，说明供试的20个自交系间具有一定的遗传多样性；聚类结果表明，20个自交系被划分为4个杂优类群，第1大类四川农业大学硕士学位论文中有模式自交系B73和Mo17，这一类群应属于Re记群和Lancaster群的衍生群。其中第I一l亚群中6983、50732、3237、52272、50242、5 1291和B73聚在一起，它们可能属于改良Reid亚群;I一4亚群中的200B和R08与Mol7聚在一起，可能属于Lancaster亚群:I一2和I一3亚群由于没有和模式自交系聚在一起，它们可能属于其他亚群。第m大类中由于有模式自交系黄早四，故该类群应属于四平头群。第IV大类包括模式自交系丹340，故该类群属于旅大红骨群。第H大类的4146、18一599、5253一3由于没有和模式自交系聚在一起，可能属于其它类群。聚类结果还表明，16个新选系中有12个被聚于I类，这在一定程度上反映出供试新选系虽有一定的遗传多样性，但它们的遗传基础相对还是较窄。 4.根据单株产量TCA表现和SSR聚类分析结果，本实验单株产量TCA前15位组合的组配方式中，I一lxl一3的有4个，11一lxl一2的有3个，Ilxl一l的有2个，I一3xl一2、Illxl一2、IVXI一2、Illxl一4、11、I一2、I一4xl一2等各l个。由此可见，单株产量TCA前15位的组合，I类中各亚类间组配的组合有9个，占60%，表明I类中各亚类间组配可产生较强的杂种优势;此外，由卜1亚类与其它类或亚类组配的组合也有9个，表明I一1亚类（改良Reid亚群）具有较大的育种潜势。 5.按Griffing方法4（模型n）对粒长、粒宽、粒厚和籽粒鲜干重差进行遗传分析，研究结果初步表明，粒长、粒宽、粒厚的加性效应大于非加性效应，它们均以加性效应为主，在选育自交系时，可进行早代选择，而在选配组合时，则应同时兼顾非加性效应:籽粒鲜干重差的加性效应虽大于非加性效应，但其环境方差明显大于遗传方差，故在选择时应以间接选择为主，且需进行多年、多点鉴定。