【摘 要】
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本文对日本血吸虫基因组采用了全基因组鸟枪法(WholeGenomeShotgunWGS)测序和拼装，获得了6倍覆盖率下的血吸虫基因组的草图。其中来自Plasmid、Fosmid和BAC三类文库的3.6兆条
【出 处】
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上海第二医科大学 上海交通大学医学院 上海交通大学
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本文对日本血吸虫基因组采用了全基因组鸟枪法(WholeGenomeShotgunWGS)测序和拼装，获得了6倍覆盖率下的血吸虫基因组的草图。其中来自Plasmid、Fosmid和BAC三类文库的3.6兆条序列。经预处理后除去载体、污染和低质量序列后，使用Phusion软件进行拼装。对于3，123,649条通过预处理的序列，Phusion将其中的2,942,815条序列分成了135,503个组，50％的序列位于分组大小超过78条序列的分组中。最后的拼装结果包含了2,801，878条序列，占起始序列数量的89.6％。Contig的数目为105,181；总长度为343,702,252；N50大小为5,363碱基。SuperContig的数目为21，651；总长为389,648,509碱基；N50大小为165,838碱基。
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