松花江流域是我国东北的重要地区，为加强对其水生态环境状况的了解，本课题对松花江流域(嫩江、第二松花江、松花江干流及它们各自的支流)的微生物数量和群落多样性进行了比对分析。应用传统平板培养法(HeterotrophicPlate Counts，HPC)和流式细胞技术(Flow Cytometric，FCM)测定水样中的细菌数；运用试剂盒法提取样品中的总DNA，以巢式PCR(Polymerase Chain Reaction)和降落PCR(Touchdown PCR)扩增细菌16SrDNA片段，PCR产物通过聚丙烯酰胺凝胶电泳(Denaturing Gradient Gel Electrophoresis，DGGE)技术对目的片段进行分离，进而对水样中的细菌群落多样性进行研究分析。利用SPSS软件作各采样点的环境影响因子和微生物数量、群落多样性的相关性分析。实验结果显示，总活细菌数的数量级在106上下，而可培养细胞数仅为104左右，在总活细菌数中所占的平均比例不超过2％。这说明平板计数法可能导致对水环境中微生物实际数量的低估；而流式细胞计数方法在微生物计数方面较有优势。整体上松花江流域干流的微生物数量要高于支流，松花江干支流一般居于三大河流数值排序的中间段；而在变化趋势上，虽然两种计数手段都未显示出松花江流域微生物数量变化的趋势，但总活细菌显示出了相对较明显的规律性。就DGGE图谱分析而言，松花江流域的部分区段出现了分区的现象，但是从整体上这种趋势并不明显。总的看来，松花江流域支流的微生物群落多样性要高于干流。这一结论可能是由于支流地形和环境因素多样性的影响，支流拥有更为丰富的微生物族群，当其中某些微生物进入主干河流后受到环境因素或污染物的影响被选择性淘汰，因此主干河流的微生物种群多样性反而不高。在采样点采集的温度、盐度、酸碱度、溶解氧和电导率这五种环境影响因子的相关性分析方面，水温和盐度是影响松花江流域水生微生物群落结构的主要影响因子；但它们对群落结构的影响与数量分布的趋势并不一致。本课题还将松花江水样的微生物数量及多样性与其他水体进行了比对：研究发现，松花江流域水体中微生物数量高于国内湖泊，与国内河流水体基本一致，但略低于国外河流；群落多样性在整体上属于较高的水平。这些分析结果有望为以后进一步从微生物角度评价松花江水质提供数据支持。此外，本课题还计划选择部分具有代表性的样品进行454焦磷酸测序，以了解松花江流域常见菌属和优势菌属的状况。