建立用于代谢组学研究的13C标记线虫模型

来源 :中国科学院大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wuzhi1979
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代谢组学由于处在系统生物学的终端,能更敏感的捕捉到机体的变化。秀丽隐杆线虫(C.elegans)已成为生物学研究的理想模式动物,如发育生物学、遗传学、神经科学等。目前,已有研究表明基于核磁共振(NMR)的代谢组学可以区分表型无差异的不同线虫株的代谢型,但核磁共振方法也具有一定的局限性,比如检测灵敏度较低;其次,由于代谢组学样品的复杂性,常规一维氢谱核磁共振方法面临谱峰重叠严重的问题。  本论文建立用于代谢组学研究的13C标记线虫模型,一方面引入高分辨二维碳氢相关谱(1H-13C HSQC谱),旨在解决生物样品一维氢谱谱峰重叠严重的问题,另一方面通过实现对代谢物的13C标记,提高二维碳氢相关谱的灵敏度,有利于代谢物的准确鉴定(定性)和定量,从而提高数据多变量统计分析结果的可靠性。与经典的培养方式比较,我们建立了一套简单高效可用于13C标记线虫的流程,研究结果表明:  a)与经典的培养方式比较,以13C标记的大肠杆菌HB101、HT115为食物在非典型线虫培养基MediumⅠ上培养线虫,线虫寿命稍微延长,但对线虫生长发育、产卵量和代谢组基本无影响,可以用作13C标记线虫的培养方式。  b)用含有Celtone的M9培养基培养的大肠杆菌OP50由于影响线虫的生长发育,不能用作13C标记线虫的食物。  c)非经典的线虫培养基MediumⅡ由于影响线虫的产卵量不能用作13C标记线虫的培养基。  本论文成功建立用于代谢组学研究的13C标记线虫的流程,联用1H-13CHSQC、3D CCH-TOCSY、3D HSQC-NOESY及LC-MS对线虫体内的代谢物进行详细归属,目前已归属70个代谢物。13C标记线虫模型的建立有助于以线虫为模式动物进行代谢组学研究的发展,为开展更广泛的代谢组学研究建立技术平台。
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