本文对治理、治理结构、高校治理结构等概念进行解读，对高校内部治理的理论基础：法人治理理论、委托——代理理论、利益相关者理论进行分析。法人治理理论强调高校作为非营利性法人各权力之间的制衡关系；委托——代理理论强调针对信息不对称的情况，解决代理问题的制衡机制和约束代理人行为的设计；利益相关者理论强调组织各利益相关者应该参与治理及治理机制对各利益相关者的协调和平衡。　　在对美、英、法等国高等教育治理结构的基本情况介绍的基础上，通过对M大学内部治理结构的分析，提出 M大学内部治理结构存在的主要问题：行政权力仍占主导地位、学术权力有待进一步加强、民主监督需进一步规范、“两个一把手”现象、治理约束和激励机制不健全等。同时，提出高校内部治理结构的优化建议和对策：全面落实“党委领导，校长治校”；充分发挥学术权力作用，实现教授治学；强化教代会的民主管理；发挥学生治理主体作用；推行职业化管理；完善治理监督机制等。