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目的：为了系统的阐述结肠癌肝转移发生发展机制,本研究利用全外显子测序的方法筛查与结肠癌肝转移发生发展相关的基因,再通过公共数据库分析相关基因的功能、基因所在的信号通路以及基因编码的蛋白质的相互作用,以期能够更好的服务于结肠癌肝转移的早期诊断和个体化治疗。同时探索一套相对简单高效的筛选与肿瘤相关基因的方法,为动物肿瘤性疾病标志物和肿瘤早期诊断提供方法学的支持。方法：1.样本处理：收集结肠癌组织、肝转移灶组织以及正常肠粘膜组织,使用组织提取试剂盒提取组织中DNA,对其进行定量以及质量评估。2.全外显子测序：再进行文库构建和外显子捕获,利用Illumina二代测序平台对于捕获的文库独立测序。3.候选基因分析：对外显子测序筛选出来的候选突变基因进行GO基因功能分析、KEGG信号通路分析和蛋白质相互作用分析,综合上述公共数据库分析结果,找到结肠癌肝转移过程中的关键基因和信号通路。结果：1.应用外显子测序方法,发现在正常肠黏膜组织中有突变基因29126个,结肠癌原发组织中突变基因27388个,肝转移灶中突变基因27955个。正常肠粘膜中突变基因与在肠原发灶和肝转移灶中共同存在的突变基因比对,去除共同突变的基因,得到非共同突变基因372个。2.对候选的372个基因进行GO、Pathway和蛋白质相互作用的分析发现部分候选基因在细胞的运动、细胞黏附、血管形成、细胞骨架成分、细胞外基质、基底膜等与转移息息相关的过程中有富集,在NOTCH信号通路、轴突导向信号通路、Hedgehog信号通路和基底细胞癌信号通路中富集,综合分析得到可能与结肠癌肝转移相关的候选基因116个。结论：NOTCH信号通路、轴突导向信号通路、Hedgehog信号通路和基底细胞癌信号通路之间有交错的调控关系并非相互独立发挥调控作用。综合GO、Pathway、蛋白质相互作用的分析结果进行筛选,得到可能与结肠癌肝转移发生相关的ADAM17、 APH1A、KAT2A等候选基因116个。本研究建立了一套相对简单有效并且花费较少的方法为肿瘤性疾病标志物的发现、肿瘤的早期诊断和个体化治疗提供方法学的支持。