甘蓝型油菜含油量QTLs定位及候选基因筛选

来源 :中国农业科学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:passtestall
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甘蓝型油菜是芸薹属植物中一种非常重要的油料作物并在世界范围内大面积的种植。甘蓝型油菜的含油量每期高一个百分点相当于产量期高2.3~2.5个百分点,所以研究甘蓝型油菜的含油量具有十分重要的意义。本论文的主要研究内容如下:1. DH群体的高低油混样转录组测序。根据DH高低油极端混样(高油混样是选择了DH群体含油量极端高的10个单株,低油混样是选择了DH群体含油量极端低的10个单株)转录组测序结果,得到了2730个差异表达基因,其中,1586个上调基因和1144个下调基因。2.引物设计和多态性扩增。因为缺少多态性的标记,我们设计了2244对公共引物、5944对新开发的基因组来源的引物和443对新开发的与含油量有关的基因来源的引物。在亲本zy036和51070中扫了2244对公用引物、5944对新开发的基因组来源的引物和443对新开发的基因引物的多态性,分别鉴定出400(17.83%)、718(12.08%)和73(16.48%)对多态性引物。3.遗传连锁图谱构建。利用DH群体构建了一个包括527个标记的遗传连锁图谱。这527个标记包括181个公用标记、298个新开发的基因组来源的标记和48个新开发的与含油量有关的基因标记。连锁图谱覆盖总长度是2,265.54cM,平均每条连锁群长度是119.34cM,标记之间的平均图距4.30cM。4.含油量QTLs定位及候选基因筛选。利用WinQTL Cartographer2.5软件进行含油量QTLs检测,共检测到17个QTLs。通过QTL定位,估计的每个QTL解释含油量表型变异(R2)是9.15%~24.56%。每个QTL的加性效应是0.35~2.05。结合50个差异表达基因开发的基因来源的引物及17个含油量QTLs区间,共得到了7个含油量候选基因。5.含油量与主花序产量及构成因子之间的相关性分析。实验表明: DH群体含油量与主花序产量、主花序有效角果数、每角粒数和千粒重之间没有明显的相关性(P>0.05);共定位了13个主花序产量、10个主花序有效角果数、15个每角粒数和23个千粒重QTLs。本论文的创新性如下:1.用两个含油量差异很大(10个百分点)的甘蓝型油菜品种构建了DH群体,设计了许多新开发的基因组和基因来源引物,定位了含油量QTLs,并得到了高油QTLs,为甘蓝型油菜含油量和产量QTL性状的精细定位、基因克隆和分子标记辅助选择(MAS)奠定了基础。2.通过把DH群体的高低油混样转录组测序得到的差异表达基因设计基因引物和含油量QTLs定位相结合,同步得到多个QTLs区间的多个含油量候选基因,为以后快速、高通量的寻找数量性状候选基因期供了可能性。3.通过分析含油量与主花序产量及构成因子之间的相关性表明,含油量与主花序产量之间相关性不明显,说明可以同步期高油菜的含油量和产量。
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