我国农业目前正面临着供需的结构性失衡，“供需错位”已成为制约中国经济持续增长的最大障碍。一方面，农业产能过剩已成为制约中国农业产业结构转型升级的一大包袱。另一方面，中国的供给体系，总体上是中低端产品过剩，高端产品供给不足。我们国家在发展“石化”农业过程中，农产品生产过剩的同时带来了环境的恶化。而且农民面临农产品增产不增收的困境。农产品供需失衡的原因有农业供给侧结构性的原因，有农产品的需求低弹性和收入低弹性的原因，但主要在于小农户和大市场之间的信息不对称，两者之间存在难以调和的矛盾。我国加快农业现代化过程中存在土地资源基础薄弱，人均户均耕地少，大国小农等突出特点，在这样的背景下，在农业结构优化升级过程中特别要注重农业生产销售各个环节的协调优化，要通过农业经营管理效率的提升来推进农业现代化的实现。订单农业是一种以销售定产量的经营管理模式，能够架起小农户和大市场之间沟通的桥梁，能够有效促进农业产业结构的优化，加快实现农业现代化。
　　本文想构建“公司+农户”型订单农业高效运行模式，也就是构建过程“三环节优化”和横纵“两方向支撑”的订单农业运行模式。从订单签订前契约设计、订单履约过程中激励机制以及订单履约后机制设计三个环节的流程优化来提升订单农业的稳定性，降低订单农业供应链的风险，同时通过横向的金融信贷支撑和纵向的技术创新效率支撑来保障订单农业顺畅运行，这种优化机制能有效连接小农户和大市场，推进农业产业结构的优化。
　　（一）在订单农业契约签订前设计保险补贴机制，降低农民农业生产风险，鼓励农户参与订单农业。政府对农业的补贴机制设计对订单农业的发展影响非常大，探讨农业保险和保费补贴是否会增加农户收益、公司的利润和社会财富非常具有现实意义。为此针对不可预测的农业生产风险，本文提出购买农业保险的解决方案，通过政府保险补贴机制的设计，来协调农业供应链中农户、公司和政府的利益。这里的农业保险相关费用由公司、农户及政府来分担，这样可以构建一种社会组织与农户利益共享、风险共担的订单农业风险协调机制。然后用山东省小麦作物的保险数据来检验政府补贴对优化订单农业的重要作用，研究发现农户购买农业保险可以对冲自然灾害造成的风险，政府对农业保险费补贴能够促进公司实现利润最大化，政府对农业保险费用的补贴对社会财富也具有明显的促进作用。
　　（二）在订单农业履约过程中设计权利金补贴机制来激励企业履行订单合同。在保护价格契约机制中，农民利益受到保护。但是，农民应该为溢价支付履约权利金，政府向农民提供权利金补贴，从而探讨权利金补贴机制对订单农业履约的影响和效果。通过对比分析公司随行收购与保底收购并享受权利金补贴两种机制下的最优决策行为。研究发现政府为农民和公司提供权利金补贴，接受保护价格机制，会使整个供应链更加稳定。通过给出风险厌恶型农户最小化CVaR（条件价值风险）和风险中性公司最大期望收益目标下农户最优生产规模、公司最优收购价格的显示表达式，然后分析参数对农户、公司和社会福利三者的影响，来探讨权利金补贴机制的效果。研究表明政府提供的权利金补贴有利于提高农户、企业和社会三方的利益，让订单农业更加稳定协调，从而能够提高订单农业的履约水平。
　　（三）订单履约后通过农产品质量分级销售的机制设计来提升公司收益和订单农业的效率。采取农产品质量分级销售模式这种协调契约的设计能够优化和协调订单农业。假定农业生产中所涉及的生产资料费用由公司支付，订单模式能够使得农户收益大于其预期收益，也就是农户满足订单农业的参与性约束条件。农户只需遵照订单要求提供土地和劳动力进行农业生产，在此基础上，公司确定收购价格使其收益最大化。通过探讨不同自然条件对最优收购价格和公司利润的影响，分析集中销售与质量分级销售模式的区别，通过对比公司采用统一价格销售与质量分级销售两种模式下公司收益，来研究质量分级销售机制的相关效应。研究发现采用质量分级销售模式更有利于提高公司的利润，质量分级形成的价格差异和收益的差异会形成一种价格信号，然后反馈到农户，引导农民根据市场需求来生产，从而优化农业资源的有效配置，促进农业产业结构优化，让农民生产适合市场需求的农产品。同时农产品质量分级销售产生的市场价格差异会激励农业生产者优化农业生产资源的配置。
　　（四）在订单农业运行过程中“三环节优化”的基础上，还需要横纵“两方向支撑”来保障订单农业的运行。横向的金融信贷支撑对订单农业的稳定协调起到了非常大的促进作用。在订单农业发展过程中为了实现横向规模效应，扩大生产规模发展适度经营，金融信贷支持至关重要。在实现订单农业横向规模效应过程中，如何提高小农户信贷配给是当前要着重关注的问题。首先对利率限制下存在信贷配给的经典模型基础进行拓展，分析利率市场化改革对不同阶层农民信贷获取的影响，然后通过建立利率市场化改革影响不同阶层农民收入的理论模型，为改革中不同规模生产者的收入变化提供了理论依据。并从风险补偿效应、借款人类型结构效应和信息不对称内生技术处理能力效应三大效应来分析信贷决策，探究不同阶层农户的信贷配给的福利效果。
　　（五）订单农业发展过程中需要发挥纵向技术创新效率的支撑作用。农业科研院所是农业技术扩散的重要载体，其对订单农业发展的技术支撑作用不可小觑，为此研究农业科研院所的创新效率有着重大的现实问题。以中国农业科研院所的省际面板数据为样本，首先构建随机前沿生产函数模型（SFA）分析农业科研院所的研发效率，由于自主创新与协同创新技术前沿面的不同，又需要构建同前沿生产函数模型（MFA）测度并分析中国农业科研院所的研发效率。然后在方法论的基础上探讨创新模式的异同对农业科研院所研发效率的影响。研究表明：两种方法下开展协同创新的农业科研院所研发效率均优于仅自主创新的农业科研院所，协同创新模式下的技术水平要优于自主创新模式下的技术水平。要积极鼓励科研院所和其它部门单位协同创新，从而促进订单农业的发展。
　　订单农业这种经营组织形式有其独特优势，在我国也面临一些突出问题，为此研究订单农业运行模式的协调优化具有非常重要的现实意义。订单签订前保险补贴机制，订单履约过程中权利金补贴激励机制以及订单履约后质量分级销售模式设计，同时通过横向的金融信贷配给的支持，农业科研院所技术创新效率的支撑来推进订单农业发展，这样系统性的机制优化能够保持订单农业的稳定性，降低订单农业违约风险，从而促进农业产业结构优化，加快实现农业现代化。