2017年陇川县新报告HIV-1阳性人群HIV基因亚型分布及耐药性研究

来源 :昆明医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:thonary09
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[目的]了解云南省德宏州陇川县2017年新报告人类免疫缺陷病毒Ⅰ型(Human Immunodeficiency Virus 1 Type,HIV-1)阳性人群HIV基因亚型分布,明确该地区HIV-1毒株的分子流行特征;了解2017年陇川县新报告HIV-1阳性人群基因亚型流行重组与变异情况,分析病毒的跨境传播、病毒的变化;了解2017年陇川县新报告HIV-1未接受抗病毒治疗人群原发耐药的流行状况,探索HIV-1流行亚型与耐药发生和流行的关系,为今后该地HIV的跨境传播防控和抗病毒治疗方案的制定提供科学依据。[方法]本次研究采用横断面调查方法,对2017年陇川县新报告HIV-1阳性人群特征进行流行病学分析。通过采集血样,分离血浆后提取核酸,使用RT-PCR和Nested-PCR扩增HIV-1 5’ LRT-pol基因序列片段,扩增产物送至擎科公司测序,测序结果使用Lasergene软件包中的SeqMan应用程序对序列进行拼接和处理;从美国Los Alamos实验室HIV核酸数据库下载亚型参考序列与扩增获得的序列合并后,使用在线工具进行比对,运用MEGA软件采用最大似然比法构建进化树;对可能发生重组的毒株基因序列用SimPlot软件进行重组分析;将5’LRT-pol基因序列上传到美国斯坦福大学耐药数据库进行耐药分析,用SPSS软件对2017年陇川县新报告HIV-1阳性人群流行病学特征和分子流行病学资料进行分析。[结果]1.2017年陇川县新报告HIV-1阳性者共156人。人口学分析结果显示:男性116人,女性40人,男女比2.9:1.0;平均年龄33.3±11.1岁,年龄主要集中在20-30岁组(41.03%);以景颇族(39.10%)、已婚者(52.56%)、文盲(63.46%)、异性性传播(67.31%)途径为主;确诊后首次CD4细胞计数平均值为392.4±255.5/mm3。其中中国籍53(33.97%)人,缅甸籍103(66.03%)人。中国籍和缅甸籍HIV-1阳性者均以男性、农民为主,中国籍HIV-1阳性者的平均年龄为39.6±13.4岁,以德昂族(47.17%)、已婚者(69.81%)、小学文化(43.40%)、异性性传播(90.57%)途径为主;缅甸籍HIV-1阳性者平均年龄为30.1±8.1岁,以景颇族(42.72%0)、未婚者(49.51%)、文盲(86.41%)、异性性传播(55.34%)途径为主。2.本研究获得有效5’LRT-pol基因序列110条。系统进化和重组分析显示:陇川县流行超过10种HIV-1基因亚型,包括2种亚型,10种CRFs和3种不同类型的URFs。其中以URF居首位,占52.73%0,其他亚型依次为CRF01AE(16.36%0)、B亚型(7.27%)、C亚型(6.36%)、CRF62BC(3.64%)、CRF08BC(3.64%)、CRF57BC(3.64%)、CRF87cpx(1.82%)、CRF07BC(0.91%0)、CRF5501B(0.91%)、CRF64BC(0.91%)、CRF65cpx(0.91%)、CRF96cpx(0.91%)。3.在110个序列中,中国籍扩增及测序成功35个样本,其中URFs同样居于首位,占28.57%,其次为CRF01AE(20.00%)。缅甸籍扩增及测序成功75个样本,也以URFs为首位,占64.00%,其次为CRF01AE(14.67%)。4.陇川县HIV-1基因亚型相关人口学特征进行Logistic多因素分析结果表明,女性感染CRF01AE的风险是男性的5.27倍(P<0.05),已婚者感染CRF01AE的风险是未婚者的0.17倍(P<0.05)。缅籍HIV-1阳性者感染URF的风险是中国籍HIV-1阳性者的3.03倍(P<0.05),异性性传播途径感染URF的风险是注射吸毒传播途径的0.28倍(P<0.05)5.110份序列耐药分析结果显示:有10条序列检出对NRTIs、PIs、NNRTIs三类抗病毒药物不同程度的耐药,耐药发生率为9.09%。缅甸籍耐药发生率为10.67%,中国籍耐药发生率为5.71%。在10个HIV/AIDS病例中有3个病例出现高度耐药,1例中度耐药,其余病例则表现为低度耐药。6.本研究在5种HIV-1 基因型(URF、CRF08BC、CRF57BC、CRF01-AE、C)中发现耐药毒株,且产生高度耐药的3个样本基因型为URF,均为缅甸籍病例。HIV-1基因型耐药检出率依次为CRF08BC为25.00%(1/4)、CRF57BC为25.00%(1/4)、C亚型为 14.29%(1/7)、URF为 10.34%(6/58)。[结论]2017年陇川县新报告HIV-1阳性者以缅甸籍、异性性传播途径感染为主。陇川县HIV-1基因亚型复杂多样,本次在陇川县共流行超过10种HIV-1基因亚型,包括2种亚型,10种CRFs和3种不同类型的URFs,其中以URF居首位,其次为CRF01-AE。HIV-1基因亚型相关人口学特征多因素分析结果表明,缅甸籍、注射吸毒途径感染HIV-1阳性者感染URF的风险显著高于其他人群。应加强注射吸毒和缅籍人群HIV-1基因亚型动态监测。陇川县HIV-1基因亚型以未知独特重组型为主,本研究对陇川县110条序列系统进化和重组分析显示:有58条序列不与已知亚型聚在一起或有相同的重组结果,在58条序列中有35条序列有两条及以上或与已知BC重组有相同的重组结构,为潜在的新CRFs,需后续扩增全基因验证。陇川县属于HIV-1原发耐药的中度流行区,该地区出现对NRTIs、PIs和NNRTIs三类抗病毒药物不同程度的耐药,以低度耐药为主,但在耐药病例中存在高度和中度耐药病例,且均为缅甸籍病例。因此,应加强监测和掌握该地耐药情况,特别是针对缅甸籍人群。不同亚型耐药突变发生不同,本研究发现,5种HIV-1基因型(URF、CRF08BC、CRF57BC、CRF01AE、C)中有耐药毒株产生,HIV-1基因型耐药检出率依次为CRF08BC、CRF57BC、C、URF。
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