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背景:耐辐射奇球菌(Deinococcus radiodurans,DR)是至今为止发现的一种对电离辐射、紫外线、强氧化剂和化学诱变剂等均具有超强耐受力的极端微生物。PprM是在研究耐辐射奇球菌pprI和pprA之间的关系时发现的一个新的依赖PprI的可能的调节蛋白,并发现pprM基因缺失菌株对γ辐射的敏感性明显增加。PprM是冷激蛋白同源物,其功能尚不完全清楚。有报道称pprM是非常重要的抗逆基因,但是关于pprM基因启动子未见报道,其在辐射抗性中的调节或被调节方式并不清楚。pprI基因被认为是辐射抗性机制的总开关,PprI蛋白是一种DNA双链结合蛋白,其功能与电离辐射抗性相关。基于PprM对PprI蛋白的依赖性,我们推测PprI蛋白可能通过结合pprM的启动子或周围序列来发挥增强pprM的抗辐射作用。 目的:本研究将首先寻找pprM的启动子,确定启动子功能,再表达和纯化PprI蛋白,利用凝胶阻滞实验观察PprI蛋白是否与预测的pprM启动子结合。本实验通过对耐辐射奇球菌pprM启动子的分析鉴定,以及与PprI蛋白相互关系的研究,为pprM基因在耐辐射球菌抗辐射调控网络中的地位与作用的阐明提供资料。对进一步探索DR菌的极端抗性与DNA修复机制具有重要的理论意义和应用价值。 方法:首先运用生物信息学方法预测pprM的启动子;再构建含有绿色荧光蛋白报告基因的表达载体以确定其是否具有启动子的功能;构建pET-28a-pprI重组表达载体并纯化蛋白,然后通过凝胶阻滞实验检测PprI蛋白与含有生物素标记的启动子探针是否结合,以确定PprI蛋白与pprM启动子或周围序列的功能关系。 结果:运用生物信息学方法预测pprM的启动子位于DR_0904至DR_0906之间。构建了含有绿色荧光蛋白报告基因、pprM基因、pprM启动子的三联表达载体,证明所预测序列具有启动子的功能。成功表达并纯化出PprI蛋白,通过EMSA方法证明PprI蛋白与预测的pprM启动子序列体外实验并没有结合关系。 结论:1.生物信息学预测的pprM基因启动子序列位于DR_0907上游2Kbp的位置,核心序列在1号染色体上的具体位置是911977~912026。2.预测的pprM启动子序列对pprM基因具有启动子功能。3.PprI蛋白与pprM启动子体外没有结合关系。