陈确是明清之际的进步思想家。他受学于刘宗周，承绪了儒家传统，却有着个性鲜明的学术思想和独特的学术风格。他对当时民间流行的迷信风水、久丧不葬等社会陋习大加批判，认为这些弊端败坏了世道人心，妨害了生民的生计。他又针对当时空谈义理的学风，写下《大学辨》，从“迹”和“理”两方面辨《大学》非圣经。其目的就是要人们实事求是，从程朱理学的束缚中解脱出来。人性论是陈确思想的重要组成部分。他认为人性首先是一种自然的本能，通过人本身的“气情才”加以体现。人性并非先天固有，也非一成不变，而是后天学习的结果。这相对于理学家在人性论问题上的形而上学观点，无疑具有进步性。 陈确的学术思想是时代内容的反映，具有很强的时代性，他不仅对理学之弊进行了批评，对阳明心学也未附和，对其师说也未固守，走的是一条理性自由的学术道路。