TCEAL3对食管鳞癌临床预后及细胞生物学行为影响的研究

来源 :甘肃中医药大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:willamshao520
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目的:食管鳞癌(Esophageal Squamous Cell Carcinoma,ESCC)作为一种常见的恶性肿瘤,尽管有多种包括新辅助治疗和靶向治疗及免疫治疗方案可供选择,但食管鳞癌治疗效果仍未得到显著改善。本研究从生物信息学分析、细胞基础实验、临床相关性研究三个维度研究与探索TCEAL3在食管鳞癌发生和发展中的作用机制。探索转录延伸因子A样3因子(Transcription elogation factor A(SⅡ)like 3,TCEAL3)可能影响食管鳞癌发生发展可能存在的细胞生物学机制。探索TCEAL3的表达可能对食管鳞癌患者预后产生的影响。探索TCEAL3在各组织及器官中的表达差异。探索TCEAL3的表达与免疫浸润的相关性。为探索食管癌的靶向治疗及生物标志物的研究提供一定的理论指导。方法:1.通过对公共数据库分析探索TCEAL3在食管癌组织与食管正常组织信使RNA层面(Messenger RNA,m RNA)的差异表达。继续通过公共数据库分析分析探索TCEAL3m RNA层面在食管鳞癌中不同临床病理学分期、不同性别的表达差异。2.收集甘肃省人民医院食管鳞癌患者的标本(癌组织及癌旁组织)制成石蜡切片进行免疫组织化学染色,观察食管鳞癌患者癌组织与癌旁组织中TCEAL3的表达情况。3.构建TCEAL3过表达的慢病毒和空载对照慢病毒,将其转染至培养好的食管鳞癌细胞中,并使它们在食管鳞癌细胞中稳定表达并用蛋白质印迹实验(Western blot,WB)进行验证。通过CCK8增殖实验探索TCEAL3过表达对食管鳞癌细胞增殖能力的影响。通过Transwell迁移实验探索TCEAL3过表达对食管鳞癌细胞迁移运动能力的影响。通过流式细胞术探索TCEAL3过表达对食管鳞癌细胞凋亡的影响。4.通过对公共数据库进行分析探索与TCEAL3m RNA层面可能相关连的基因,并进行相关性分析。通过STRING-DB在线网站分析与TCEAL3蛋白质层面相关联的蛋白。5.通过蛋白质印迹的方法探索TCEAL3过表达对前期生物信息学分析得到的相关基因的影响,探索TCEAL3可能影响食管鳞癌发生发展可能存在的分子生物学机制。6.通过对公共数据库分析探索TCEAL3及相关基因m RNA层面的表达与食管鳞癌患者生存期的关系,并绘制总生存期(Overall Survival,OS)的相关曲线。7.通过对TCGA/GTEx数据库中TCEAL3在人体各组织器官m RNA层面的表达情况进行生物信息学泛癌分析,并观察其在m RNA层面的表达情况。8.将前期得到的TCEAL3及相关基因的m RNA进行GSEA及KEGG富集分析,预测TCEAL3在人体食管癌中可能影响的相关通路及代谢机制。9.通过生物信息学分析的方法探索TCEAL3m RNA层面与免疫浸润的相关性。10.应用SPSS26.0等相关分析软件对食管鳞癌患者临床资料及相关统计学数据进行分析。结果:1.通过Xena-Shiny生物信息学在线网站对TCGA/GTEx数据库探索发现TCEAL3m RNA层面的表达在食管癌肿瘤组的表达低于正常组,差异有统计学意义(P<0.05)。通过生物信息学分析发现,TCEAL3m RNA层面上的表达与临床病理学分期无明显统计学差异(P>0.05),与性别也无明显统计学意义(P>0.05)。2.免疫组织化学染色结果显示TCEAL3在食管鳞癌组织的表达低于癌旁组织,差异有统计学意义(P<0.01)。TCEAL3的表达量与肿瘤的临床病理学分期、性别、肿瘤长度等无关,无明显统计学差异(P>0.05)。3.分别将构建好的TCEAL3过表达慢病毒与对照组慢病毒转染至正常培养的食管鳞癌细胞中,结果发现转染组细胞(TE-1-LV与KYSE-30-LV)的增殖能力、迁移运动能力都要低于对照组细胞(TE-1-NC与KYSE-30-NC)(P<0.05),差异有统计学意义。转染组细胞(TE-1-LV与KYSE-30-LV)凋亡数量明显多于对照组(TE-1-NC与KYSE-30-NC)(P<0.001),差异有统计学意义。4.通过对Linked-Omics生物信息学在线网站对公共数据库进行分析,探索在m RNA层面与TCEAL3可能相关连的基因过程中,我们发现TCEAL3与高迁移率族蛋白A1(High mobility group protein A1,HMGA1)的表达关系密切并进行了Spearman相关性分析,通过STRING-DB生物信息学在线网站对TCEAL3蛋白质层面相关的蛋白进行探索,发现TCEAL3与HMGA1同样联系密切。5.通过蛋白质印迹实验发现,TCEAL3过表达使肿瘤相关蛋白HMGA1的表达量下调(P<0.01),差异有统计学意义。同样的,TCEAL3过表达使肿瘤相关蛋白基质金属蛋白酶2(Matrix Metallopeptidase 2,MMP2)蛋白表达量下调(P<0.01),差异有统计学意义。6.通过Kaplan-Meier Plotter生物信息学在线网站对数据库中81个食管鳞癌患者样本中TCEAL3m RNA层面的表达情况对食管鳞癌患者生存的影响探索发现,TCEAL3的高低表达对食管鳞癌患者生存影响无明显统计学差异(P>0.05),但TCEAL3高表达患者的OS略长于TCEAL3低表达患者。我们认为有一定的临床意义。同样的,HMGA1的高低表达对食管鳞癌患者生存影响无明显统计学差异(P>0.05),HMGA1低表达的食管鳞癌患者的OS略长于HMGA1高表达的食管鳞癌患者。我们认为也有一定的临床意义。7.通过Xena-Shiny生物信息学网站对TCGA/GTEx数据库中各器官的表达情况进行m RNA层面的泛癌分析。结果显示,TCEAL3在大多数器官及组织中恶性肿瘤组的表达低于正常组。8.通过Linked-Omics生物信息学在线网站将前期得到的TCEAL3及相关基因进行富集分析,发现TCEAL3与包括Ras/Raf/MAPK、p38/MAPK及甲基化等多条肿瘤通路及代谢途径关系密切。9.对Xena-Shiny生物信息学在线网站进行分析探索TCEAL3m RNA层面的表达与免疫浸润相关性的探索发现TCEAL3与肥大细胞、NK细胞、巨噬细胞M2等免疫细胞的功能作用密切相关。结论:本研究表明1.TCEAL3低表达于食管鳞癌组织中,但TCEAL3的表达可能与食管鳞癌临床病理学分期、性别、肿瘤长度等无关。2.TCEAL3过表达可以抑制食管鳞癌细胞的增殖能力与迁移运动能力。TCEAL3过表达可以促进食管鳞癌细胞的凋亡。3.TCEAL3高表达的食管鳞癌患者预后可能比TCEAL3低表达的食管鳞癌患者预后好。4.TCEAL3过表达可以抑制HMGA1及MMP2肿瘤相关蛋白进而促进肿瘤细胞凋亡。5.TCEAL3m RNA层面的表达水平可能与肥大细胞、NK细胞、巨噬细胞的增生有关。6.为食管癌患者的生物标志物及靶向药物的研究及治疗带来了一定的前景。
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