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持续吸烟和过度饮酒是现今世界上主要的公共卫生问题。酒精依赖和尼古丁依赖是促成发病和死亡的两大主要因素,属于受环境因素和遗传影响的复杂疾病,两者表现出高度的共患病现象。流行病学研究表明吸烟和饮酒之间的关联性,但是他们的关联本质还不清楚。尽管传统全基因组关联研究(GWAS)已经鉴定了一些与酒精和尼古丁依赖相关联的单核苷酸多态性(SNPs),但是这些SNPs仅仅只解释了部分估计的遗传力。在本项研究中,我们运用最新的遗传基因多效性统计方法分析现有的GWAS数据,用来系统的探索吸烟行为(吸烟开始,吸烟开始年龄,每天吸烟数量)与饮酒行为(饮酒,酒精消耗)之间共享的遗传多效位点。首先,使用分层Q-Q图来表现饮酒行为和吸烟行为的多效基因富集情况。饮酒和吸烟行为各表型的分层Q-Q图曲线表示饮酒和吸烟数量、吸烟开始存在显著多效富集,饮酒和吸烟开始年龄多效富集不明显。酒精消耗和吸烟行为各表型的分层Q-Q图曲线表示酒精消耗和吸烟开始之间存在部分多效富集情况,与吸烟数量之间有少许的多效富集,但是与吸烟开始年龄之间表现出不存在富集。运用条件错误发现率(cFDR)方法,结合独立的吸烟行为各表型和饮酒行为各表型的GWAS样本,我们鉴定了17个位点与吸烟行为有关,36个位点与饮酒行为有关,阈值为condFDR≤0.05。共发现有14个位点与吸烟和饮酒两者同时相关(conjFDR≤0.05),其中4个SNPs(rs6265,rs11783438,rs1564499,rs11784248)分别位于BDNF基因、CSMD1基因、ADAMTS7基因和SGCZ基因区域。这四个基因上的一些变异位点曾在大样本全基因组关联研究中被报道分别与吸烟行为各表型表现出边缘显著性。我们的研究充分验证了这些边缘显著结果,还发现这些基因同时可能与饮酒行为有关,可能对烟碱依赖和酒依赖共患病的了解有重要意义。剩余的10个多效基因位点均被鉴定与吸烟行为和饮酒行为可能相关。发现的这些基因位点可能不一定反映真实的遗传多效性,但是,这些共享位点可能是尼古丁依赖与酒依赖潜在的共同基础,需要在更大更详细的表型样本中进行探索以及进一步的实验工作来阐明这些发现的生物学基础。总之,我们的研究使用最新的遗传多效基因发现方法鉴定了一些与吸烟行为和饮酒行为相关的新的常见基因变异,而这些新的位点在传统GWAS方法分析中没有被发现。鉴定的多效基因位点表明尼古丁依赖和酒依赖之间潜在的共同病理机制,对尼古丁依赖和酒依赖的治疗有重要意义。