马铃薯块茎形状基因的遗传定位与分子标记开发

来源 :中国农业科学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jimiwison
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本研究利用二倍体马铃薯块茎形状(薯形)分离群体材料基于马铃薯基因组序列信息结合分离群体分组分析法(BSA)开发标记,同时结合薯形分离群体表型鉴定结果构建了薯形基因Ro区域遗传图谱;利用四倍体材料对开发的分子标记进行检测,获得了一个圆形薯形分子标记,可应用于马铃薯标记辅助育种。主要结果如下:1.连续4年对薯形分离群体进行了表型鉴定。利用二倍体长形亲本10618-01和圆形亲本320-02杂交,对获得的F1代薯形分离群体进行表型鉴定,结果做卡方适合性检验表明长薯形和圆薯形基因型比例符合1:1,证明薯形是由单基因控制的。另外,从薯形频率分布图可看出,块茎形状的分布比例并不呈现明显的长圆双峰形状而是倾向于圆形,说明除了基因Ro控制薯形外,还存在其它微效基因的修饰作用。2.开发了17个薯形分子标记。根据马铃薯基因组相关序列信息并结合分离群体分组分析法(BSA)开发了17个与薯形基因Ro紧密连锁的分子标记。17个分子标记中包括13个CAPS标记、3个dCAPS标记及1个SCAR标记,13个CAPS标记和3个dCAPS标记均为共显性标记,SCAR标记为显性标记,其中6个标记是与圆形薯形性状以相斥相连锁的。3.构建了薯形基因Ro区域遗传图谱。利用开发的17个分子标记结合薯形分离群体表型鉴定结果,利用Joinmap4.0软件构建了Ro基因区域遗传图谱,该遗传图谱覆盖的区域长度为44.7cM,标记之间的平均图距为2.63cM,将Ro基因定位于542-CAPS和1137-CAPS 2.8cM区间内,物理距离约为460kb,其中1137-CAPS标记与Ro基因的遗传距离最近,约为0.2c M。4.开发了一个可应用于马铃薯分子标记辅助育种的标记。利用53份来源于51个杂交组合的四倍体品系对开发的17个与薯形紧密连锁的分子标记进行检测,获得了一个与四倍体马铃薯圆形块茎性状连锁的标记1137-CAPSVI,该标记与圆薯形吻合度达91.42%,表明该标记可应用于马铃薯分子标记辅助育种。
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