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目的:探索三阶段DEA模型的原理和方法,利用三阶段DEA模型分析河南省79家三级公立医院(含综合医院、中医医院、专科医院)的投入-产出效率,以及财政、科教投入等政策环境因素对效率的影响。方法:以2015年《河南省卫生计生财务年报》为主要数据来源,收集河南省79所综合、中医、专科类三级公立医院的卫技人员数、平均开放床位数、固定资产、诊疗人次、出院人数、业务收入等方面的数据,运用三阶段DEA模型,对在剔除政策环境因素、随机误差影响前、后的投入-产出效率进行测度和分析。结果:1.第一阶段DEA模型结果显示,综合运营效率均值(TE1)排序为:专科医院(0.769)>综合医院(0.750)>中医医院(0.712);纯技术效率均值(PTE1)排序为:中医医院(0.811)>专科医院(0.790)>综合医院(0.768);规模效率均值(SE1)排序为:综合医院(0.976)>专科医院(0.970)>中医医院(0.873)。2.第二阶段SFA回归分析显示,对于综合医院而言,财政投入的增加对平均开放床位数效率提升影响不明显,但会提高固定资产的利用,科教投入的增加会提高平均开放床位数和固定资产的利用。对于中医医院而言,财政投入的增加对卫技人员、平均开放床位数和固定资产投入影响不明显,科教投入的增加会提高卫技人员和平均开放床位数投入的利用率,对固定资产投入的利用率影响不明显。对于专科医院而言,财政投入的增加会提高固定资产的利用,但科教投入的对三个投入的利用影响不明显。3.第三阶段DEA模型结果显示,剔除财政投入和科教投入等外部环境因素和随机误差变量的影响后,综合医院的“净运营效率”较第一阶段有所增加,中医医院和专科医院的“净运营效率”则有所降低。结论:1.三阶段DEA模型在测算河南省公立医院投入-产出效率时具有可行性。2.当前河南省三级公立医院投入-产出效率仍有较大提升空间。3.财政投入、科教投入等外部因素对公立医院投入-产出效率存在差异性,实践中应考虑差异化的财政补助政策。