苏尼特羊GDF9基因关联性分析及其突变对启动子活性的影响

来源 :内蒙古大学 | 被引量 : 3次 | 上传用户:houjz
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
蒙古羊及其亚种广泛分布在我国长江以北,蒙古高原及中亚地区,具有耐寒、耐粗饲和肉质鲜美等优良特征。因其繁殖力较低,影响了蒙古羊体系的生产效率。本研究采集苏尼特羊260只(其中经产单羔羊183只,经产双羔羊77只)作为试验样本,同时采集乌珠穆沁羊36只、呼伦贝尔羊(大尾型)、呼伦贝尔羊(小尾型)、小尾寒羊与湖羊各30只,研究样本总数为416只。利用PCR-RFLP及直接测序技术,挖掘和分析苏尼特羊GDF9基因存在的突变位点及其对苏尼特羊产羔数的影响,并对其进行遗传多样性分析、生物信息学分析和功能性验证。结果表明:(1)在苏尼特羊群体GDF9(生长分化因子9,Growth differentiation factor 9)基因中发现11个SNP(单核苷酸多态性,Single nucleotide polymorphism),在这11个突变位点中有两组突变位点属于连锁不平衡(Linkage disequilibrium,LD),分别为LD1(g.41770932C>T SNP+g.41771134A>G SNP+g.41771380C>T SNP)和LD2(g.41771007G>T SNP+g.41771305A>G SNP+g.41771380C>T SNP),且g.41770718T>G SNP与LD1在产双羔母羊群体中呈一定的相互连锁;关联性分析结果表明,g.41770718T>G(P<0.01)、LD1(P<0.001)、p.Ser347Phe(P<0.05)和c.1525A>G SNP(P<0.01)与苏尼特羊平均产羔数显著相关;(2)双荧光素酶对启动子活性分析表明,g.41770932C>T SNP在LD1中起主要作用,并且在启动子上游-177bp处为GDF9的核心启动子;G等位基因在-118处(g.41770718T>G SNP)可使GDF9启动子活性下降,而T等位基因在-332处(LD1的g.41770932C>T SNP)可使其启动子活性上升,当G和T等位基因同时存在于-118和-332,同样使启动子活性上升。上述结果表明,g.41770932C>T SNP(LD1)位点可以显著影响GDF9基因的表达量,且与苏尼特羊产羔数显著相关。
其他文献
常用的文档相似度计算方法主要包括集合模型方法、向量空间模型方法、潜在语义分析法等,这些方法仅利用文本信息计算文档相似度。然而,科技文档中包含着大量的非文本信息,如公式、图和表,从而使得原有方法已不太适用。本文提出一种基于文本和公式的科技文档相似度计算方法。该方法主要考虑科技文档中的文本和公式信息,在得到文本相似度和文档间公式相似度的基础上,利用线性组合方法得到科技文档相似度。在MREC数据集上的实
<正>第一次遇见《火鸟》不是在虚无的梦境里,亦不是在灰白的现实中,而是西方现代主义音乐作曲家斯特拉文斯基用音乐的魔力,让我与一只神奇灵动的火鸟邂逅。斯特拉文斯基是20
为提升用户的安全体验,在以往心理学研究用户体验基础上,将用户体验与用户认知的动态过程进行对比,发现用户安全体验的本质是用户对安全的认知过程。再结合ACT理论对用户安全
阐述语义模型在生物医学领域的研究和应用现状,提出构建一个以细胞系为中心,包含基因、突变与疾病间语义关系的语义网络,详细介绍语义网络的设计流程、数据处理方法与步骤,比
为解决单片机实验室设备少和设备维护困难问题,利用Proteus虚拟技术设计了一个51单片机基础实验仿真系统。以51单片机为控制器核心,搭建8个基础实验电路,能够实现控制I/O口操
目的探讨在危重新生儿转运护理中应用"STABLE"技术对转运成功率的影响。方法对2011年1月至2012年3月转运的危重新生儿498例资料进行分析。结果 498例新生儿平均转运时间为(1.
<正>十六世纪英国的菲利普·锡德尼在他的著作《为诗辩护》中,曾对先哲柏拉图下过一个著名的论断:"任何好好研究柏拉图的人都会发现,虽然他的作品内容和力量是哲学的,它们的
<正> 邵阳市位于湖南省中部资水上游,统辖城东、城西、桥头、郊区四个城近郊区,以及邵东、新邵、邵阳、隆回、洞口、武冈、新宁、绥宁、城步九个郊区县。全市面积两万零九百
2008年1月1日,《劳动合同法》正式生效,其中对劳务派遣进行了特别规定,分析清楚三方主体之间的法律关系,是法律能否正确适用的关键。本文在这部法规和目前学者已有研究成果的